RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-207ENST00000418674 ST18O60284 1047 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-207ENST00000418674 DOK7Q18PE1 504 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-207ENST00000418674 TMC2Q8TDI7 906 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-207ENST00000418674 RIMBP2O15034 1052 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-207ENST00000418674 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-207ENST00000418674 C2orf72A6NCS6 295 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-207ENST00000418674 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-207ENST00000418674 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-207ENST00000418674 KIF3CO14782 793 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-207ENST00000418674 MARVELD3Q96A59 401 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-207ENST00000418674 EMP3P54852 163 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-207ENST00000418674 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-207ENST00000418674 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-207ENST00000418674 MMRN1Q13201 1228 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-207ENST00000418674 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-207ENST00000418674 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-207ENST00000418674 FOXK1P85037 733 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 FAM205CA6NFA0 338 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 SLC34A2O95436 690 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 PDE4AP27815 886 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 DSG2Q14126 1118 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 GPR153Q6NV75 609 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 PLPP6Q8IY26 295 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 ARSIQ5FYB1 569 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 ERBB3P21860 1342 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 CFAP44Q96MT7 982 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-207ENST00000418674 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.225e-7■■□□□ 12.4
PTPRC-207ENST00000418674 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 TBC1D12O60347 775 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 NUDT7P0C024 238 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 POTEB3A0JP26 581 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 POTEBQ6S5H4 581 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 MFSD10Q14728 455 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-207ENST00000418674 OXER1Q8TDS5 423 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-207ENST00000418674 LHX6Q9UPM6 363 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-207ENST00000418674 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-207ENST00000418674 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-207ENST00000418674 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-207ENST00000418674 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-207ENST00000418674 MAP3K9P80192 1104 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-207ENST00000418674 SLC24A1O60721 1099 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-207ENST00000418674 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-207ENST00000418674 WDR70Q9NW82 654 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-207ENST00000418674 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-207ENST00000418674 EVI5O60447 810 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-207ENST00000418674 PBX2P40425 430 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-207ENST00000418674 CAMK2BQ13554 666 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-207ENST00000418674 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-207ENST00000418674 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-207ENST00000418674 DPYSL4O14531 572 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 PLCB2Q00722 1185 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 E2F4Q16254 413 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 ARHGAP33O14559 1287 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 JPH4Q96JJ6 628 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 KCNH8Q96L42 1107 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 FOSBP53539 338 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 PTGER2P43116 358 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 PSEN2P49810 448 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 KCNK17Q96T54 332 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-207ENST00000418674 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 PHF14O94880 888 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 PDIA6Q15084 440 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 PTPREP23469 700 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 FBXW7Q969H0 707 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 TK2O00142 265 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 EPAS1Q99814 870 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 DDX12PQ92771 950 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-207ENST00000418674 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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