RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 OCEL1Q9H607 264 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-205ENST00000391970 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-205ENST00000391970 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 PLCG2P16885 1265 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 SEMA3EO15041 775 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 FOXK1P85037 733 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 DSG2Q14126 1118 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 TMC2Q8TDI7 906 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 G3V3G9 751 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 METRNQ9UJH8 293 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 KIF3CO14782 793 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 SEC24BO95487 1268 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 SLC39A7Q92504 469 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-205ENST00000391970 C2orf72A6NCS6 295 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 POTEB2H3BUK9 544 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 C7P10643 843 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 LHX8Q68G74 356 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 POTEFA5A3E0 1075 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 DPYSL4O14531 572 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 PLPP6Q8IY26 295 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 PDIA6Q15084 440 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-205ENST00000391970 POTEJP0CG39 1038 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-205ENST00000391970 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-205ENST00000391970 OXER1Q8TDS5 423 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-205ENST00000391970 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-205ENST00000391970 ZMYND10O75800 440 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-205ENST00000391970 MAP3K9P80192 1104 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-205ENST00000391970 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-205ENST00000391970 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 OTUD5Q96G74 571 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 BARGINQ6ZT62 677 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 PTGER2P43116 358 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D12O60347 775 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 SLC34A2O95436 690 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 GPR37O15354 613 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 EVI5O60447 810 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 OSBPP22059 807 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 DDX12PQ92771 950 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 NEUROD2Q15784 382 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 AK7Q96M32 723 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 NUTM2FA1L443 756 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-205ENST00000391970 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 FCHSD2O94868 740 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 PHF14O94880 888 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM66O15016 1216 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 GNPATO15228 680 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 MAP2K5Q13163 448 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 HIC1Q14526 733 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 EPAS1Q99814 870 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 PTGDRQ13258 359 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 DOK7Q18PE1 504 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC102AQ96A19 550 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 JPH4Q96JJ6 628 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 IRF6O14896 467 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 FECHP22830 423 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 PDE4DQ08499 809 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 MAP3K7O43318 606 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 FBXW7Q969H0 707 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-205ENST00000391970 RIMBP2O15034 1052 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 FOSBP53539 338 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
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