RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384045.1

RNU6-44P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 44, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-44P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-44P-201ENST00000384045 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-44P-201ENST00000384045 TK2O00142 265 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-44P-201ENST00000384045 GSE1Q14687 1217 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-44P-201ENST00000384045 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-44P-201ENST00000384045 STAC3Q96MF2 364 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-44P-201ENST00000384045 ARHGAP33O14559 1287 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-44P-201ENST00000384045 HRO43593 1189 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-44P-201ENST00000384045 MICALL2Q8IY33 904 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-44P-201ENST00000384045 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-44P-201ENST00000384045 LAPTM4AQ15012 233 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-44P-201ENST00000384045 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-44P-201ENST00000384045 PTPN5P54829 565 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-44P-201ENST00000384045 NUDT7P0C024 238 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-44P-201ENST00000384045 LHX6Q9UPM6 363 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-44P-201ENST00000384045 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-44P-201ENST00000384045 LCE2BO14633 110 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-44P-201ENST00000384045 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-44P-201ENST00000384045 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-44P-201ENST00000384045 ZNF787Q6DD87 383 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-44P-201ENST00000384045 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-44P-201ENST00000384045 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-44P-201ENST00000384045 GFRA3O60609 400 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-44P-201ENST00000384045 PSEN2P49810 448 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-44P-201ENST00000384045 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-44P-201ENST00000384045 SLC34A2O95436 690 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-44P-201ENST00000384045 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-44P-201ENST00000384045 SOX12O15370 315 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-44P-201ENST00000384045 KCNH8Q96L42 1107 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-44P-201ENST00000384045 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-44P-201ENST00000384045 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-44P-201ENST00000384045 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-44P-201ENST00000384045 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-44P-201ENST00000384045 KLHL34Q8N239 644 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-44P-201ENST00000384045 WNT2BQ93097 391 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-44P-201ENST00000384045 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-44P-201ENST00000384045 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-44P-201ENST00000384045 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-44P-201ENST00000384045 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-44P-201ENST00000384045 KIF3CO14782 793 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-44P-201ENST00000384045 C2orf72A6NCS6 295 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-44P-201ENST00000384045 KCNK17Q96T54 332 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-44P-201ENST00000384045 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-44P-201ENST00000384045 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-44P-201ENST00000384045 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-44P-201ENST00000384045 PHF8Q9UPP1 1060 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-44P-201ENST00000384045 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-44P-201ENST00000384045 FBXO3Q9UK99 471 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-44P-201ENST00000384045 KCNC4Q03721 635 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-44P-201ENST00000384045 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-44P-201ENST00000384045 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-44P-201ENST00000384045 STK17AQ9UEE5 414 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-44P-201ENST00000384045 NLRP6P59044 892 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-44P-201ENST00000384045 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-44P-201ENST00000384045 NBPF3Q9H094 633 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-44P-201ENST00000384045 TREML4Q6UXN2 200 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-44P-201ENST00000384045 TMC2Q8TDI7 906 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-44P-201ENST00000384045 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 TBC1D12O60347 775 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 TRIM41Q8WV44 630 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 PTPREP23469 700 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-44P-201ENST00000384045 SPOCK2Q92563 424 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-44P-201ENST00000384045 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-44P-201ENST00000384045 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-44P-201ENST00000384045 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-44P-201ENST00000384045 BCAMP50895 628 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-44P-201ENST00000384045 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-44P-201ENST00000384045 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-44P-201ENST00000384045 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 VGFO15240 615 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 WBP1LQ9NX94 342 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 POTECB2RU33 542 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 FKBP8Q14318 412 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 WFS1O76024 890 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 MYT1Q01538 1121 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 PKDCCQ504Y2 493 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 WIPF1O43516 503 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 DGAT1O75907 488 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 FOXK1P85037 733 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 MFRPQ9BY79 579 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-44P-201ENST00000384045 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-44P-201ENST00000384045 PLPP6Q8IY26 295 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-44P-201ENST00000384045 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-44P-201ENST00000384045 FOSBP53539 338 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-44P-201ENST00000384045 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-44P-201ENST00000384045 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-44P-201ENST00000384045 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-44P-201ENST00000384045 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-44P-201ENST00000384045 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-44P-201ENST00000384045 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms