RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 POTEIP0CG38 1075 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFSD10Q14728 455 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 E2F4Q16254 413 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMC2Q8TDI7 906 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-78P-201ENST00000362897 POTEFA5A3E0 1075 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSG2Q14126 1118 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 C2orf72A6NCS6 295 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAMK2BQ13554 666 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXK1P85037 733 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF3CO14782 793 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-78P-201ENST00000362897 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLPP6Q8IY26 295 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPYSL4O14531 572 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA3EO15041 775 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDIA6Q15084 440 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP3K9P80192 1104 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 OXER1Q8TDS5 423 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 POTEJP0CG39 1038 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 POTEB2H3BUK9 544 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBC1D12O60347 775 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC34A2O95436 690 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.09□□□□□ -1.43
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RNU6-78P-201ENST00000362897 EVI5O60447 810 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 DOK7Q18PE1 504 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-78P-201ENST00000362897 RIMBP2O15034 1052 aa6.05□□□□□ -1.44
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RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.02□□□□□ -1.45
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RNU6-78P-201ENST00000362897 OSBPP22059 807 aa6.01□□□□□ -1.45
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RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDT7P0C024 238 aa5.99□□□□□ -1.45
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RNU6-78P-201ENST00000362897 EPAS1Q99814 870 aa5.99□□□□□ -1.45
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RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF454Q8N9F8 522 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXW7Q969H0 707 aa5.97□□□□□ -1.45
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RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC24A3Q9HC58 644 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIC1Q14526 733 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZDHHC16Q969W1 377 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDHR5Q9HBB8 845 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 LHX6Q9UPM6 363 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNPATO15228 680 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTGDRQ13258 359 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP2K5Q13163 448 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
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