RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 EMP3P54852 163 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 NLRP6P59044 892 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 CFAP44Q96MT7 982 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLCB2Q00722 1185 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 OCEL1Q9H607 264 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM205CA6NFA0 338 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP1R37O75864 691 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLCG2P16885 1265 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNPHO15079 494 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 MICALL2Q8IY33 904 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 G3V3G9 751 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC24A1O60721 1099 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 C2orf72A6NCS6 295 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIF3CO14782 793 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDE4AP27815 886 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMC2Q8TDI7 906 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFSD10Q14728 455 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 DSG2Q14126 1118 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOXK1P85037 733 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLPP6Q8IY26 295 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDR70Q9NW82 654 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAMK2BQ13554 666 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 E2F4Q16254 413 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTGER2P43116 358 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC34A2O95436 690 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 OXER1Q8TDS5 423 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERBB3P21860 1342 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-227P-201ENST00000362865 DOK7Q18PE1 504 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 P3H3Q8IVL6 736 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 DPYSL4O14531 572 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR153Q6NV75 609 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAP3K9P80192 1104 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARSIQ5FYB1 569 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 RIMBP2O15034 1052 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBC1D12O60347 775 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 EVI5O60447 810 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDIA6Q15084 440 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUDT7P0C024 238 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEMA3EO15041 775 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 NBR1Q14596 966 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 LHX6Q9UPM6 363 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 HCSTQ9UBK5 93 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDX12PQ92771 950 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 BCANQ96GW7 911 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 RGS20O76081 388 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOSBP53539 338 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q6ZNB5 142 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 JPH4Q96JJ6 628 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHF14O94880 888 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 OSBPP22059 807 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.3□□□□□ -1.4
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