RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 POTEMA6NI47 508 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-201ENST00000264779 TMC2Q8TDI7 906 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-201ENST00000264779 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-201ENST00000264779 POTEGQ6S5H5 508 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-201ENST00000264779 KIF3CO14782 793 aa8.68□□□□□ -1.02
GPBP1-201ENST00000264779 DOK7Q18PE1 504 aa8.67□□□□□ -1.02
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.67□□□□□ -1.02
GPBP1-201ENST00000264779 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
GPBP1-201ENST00000264779 MARVELD3Q96A59 401 aa8.66□□□□□ -1.02
GPBP1-201ENST00000264779 RIMBP2O15034 1052 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-201ENST00000264779 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-201ENST00000264779 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-201ENST00000264779 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-201ENST00000264779 CFAP44Q96MT7 982 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-201ENST00000264779 EMP3P54852 163 aa8.61□□□□□ -1.03
GPBP1-201ENST00000264779 DSG2Q14126 1118 aa8.6□□□□□ -1.03
GPBP1-201ENST00000264779 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-201ENST00000264779 FOXK1P85037 733 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-201ENST00000264779 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-201ENST00000264779 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 PLPP6Q8IY26 295 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 ARSIQ5FYB1 569 aa8.57□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 GPR153Q6NV75 609 aa8.57□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 PDE4AP27815 886 aa8.56□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 FAM205CA6NFA0 338 aa8.56□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.044e-7■■■■□ 25.4
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GPBP1-201ENST00000264779 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.55□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 SLC34A2O95436 690 aa8.53□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.53□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.53□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.53□□□□□ -1.04
GPBP1-201ENST00000264779 ERBB3P21860 1342 aa8.52□□□□□ -1.05
GPBP1-201ENST00000264779 NUDT7P0C024 238 aa8.51□□□□□ -1.05
GPBP1-201ENST00000264779 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-201ENST00000264779 POTEB3A0JP26 581 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-201ENST00000264779 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-201ENST00000264779 POTEBQ6S5H4 581 aa8.5□□□□□ -1.05
GPBP1-201ENST00000264779 MFSD10Q14728 455 aa8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-201ENST00000264779 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GPBP1-201ENST00000264779 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.48□□□□□ -1.05
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GPBP1-201ENST00000264779 TBC1D12O60347 775 aa8.45□□□□□ -1.06
GPBP1-201ENST00000264779 OXER1Q8TDS5 423 aa8.45□□□□□ -1.06
GPBP1-201ENST00000264779 LHX6Q9UPM6 363 aa8.44□□□□□ -1.06
GPBP1-201ENST00000264779 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.43□□□□□ -1.06
GPBP1-201ENST00000264779 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.43□□□□□ -1.06
GPBP1-201ENST00000264779 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.41□□□□□ -1.06
GPBP1-201ENST00000264779 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.4□□□□□ -1.06
GPBP1-201ENST00000264779 PLCB2Q00722 1185 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-201ENST00000264779 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-201ENST00000264779 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.4□□□□□ -1.07
GPBP1-201ENST00000264779 MAP3K9P80192 1104 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.38□□□□□ -1.07
GPBP1-201ENST00000264779 WDR70Q9NW82 654 aa8.38□□□□□ -1.07
GPBP1-201ENST00000264779 CAMK2BQ13554 666 aa8.38□□□□□ -1.07
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GPBP1-201ENST00000264779 E2F4Q16254 413 aa8.34□□□□□ -1.07
GPBP1-201ENST00000264779 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.3□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 PBX2P40425 430 aa8.3□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 FOSBP53539 338 aa8.3□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.3□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.29□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 JPH4Q96JJ6 628 aa8.29□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 ARHGAP33O14559 1287 aa8.27□□□□□ -1.08
GPBP1-201ENST00000264779 PSEN2P49810 448 aa8.27□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 KCNK17Q96T54 332 aa8.27□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 PDIA6Q15084 440 aa8.26□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 DDX12PQ92771 950 aa8.25□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.25□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.25□□□□□ -1.09
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GPBP1-201ENST00000264779 KCNH8Q96L42 1107 aa8.25□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.24□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.24□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 MMRN1Q13201 1228 aa8.23□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.23□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 PHF14O94880 888 aa8.22□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 PTPREP23469 700 aa8.22□□□□□ -1.09
GPBP1-201ENST00000264779 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.21□□□□□ -1.1
GPBP1-201ENST00000264779 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.2□□□□□ -1.1
GPBP1-201ENST00000264779 PTGER2P43116 358 aa8.2□□□□□ -1.1
GPBP1-201ENST00000264779 NBR1Q14596 966 aa8.2□□□□□ -1.1
GPBP1-201ENST00000264779 FBXW7Q969H0 707 aa8.2□□□□□ -1.1
GPBP1-201ENST00000264779 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GPBP1-201ENST00000264779 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.18□□□□□ -1.1
GPBP1-201ENST00000264779 P3H3Q8IVL6 736 aa8.18□□□□□ -1.1
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