RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000214869.6

TMED1-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED1, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1-201ENST00000214869 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
TMED1-201ENST00000214869 PLCH2O75038 1416 aa23.81■■□□□ 1.4
TMED1-201ENST00000214869 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.79■■□□□ 1.4
TMED1-201ENST00000214869 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
TMED1-201ENST00000214869 GLI2P10070 1586 aa23.76■■□□□ 1.39
TMED1-201ENST00000214869 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.74■■□□□ 1.39
TMED1-201ENST00000214869 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.74■■□□□ 1.39
TMED1-201ENST00000214869 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
TMED1-201ENST00000214869 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.72■■□□□ 1.39
TMED1-201ENST00000214869 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.71■■□□□ 1.39
TMED1-201ENST00000214869 PTPRKQ15262 1439 aa23.7■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.7■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 DAPK1P53355 1430 aa23.69■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.69■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.68■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.68■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 ABCC5O15440 1437 aa23.68■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 DIP2BQ9P265 1576 aa23.67■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 MBD5Q9P267 1494 aa23.66■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 AKNAQ7Z591 1439 aa23.66■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 ITGAEP38570 1179 aa23.65■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 ABCC1P33527 1531 aa23.64■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 CD109Q6YHK3 1445 aa23.64■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.64■■□□□ 1.38
TMED1-201ENST00000214869 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.64■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.62■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 FANCAO15360 1455 aa23.62■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.62■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 ROCK1Q13464 1354 aa23.62■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.6■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 HFM1A2PYH4 1435 aa23.6■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.6■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.59■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.59■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 ADGRL2O95490 1459 aa23.59■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.59■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.58■■□□□ 1.37
TMED1-201ENST00000214869 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.57■■□□□ 1.36
TMED1-201ENST00000214869 HRCP23327 699 aa23.57■■□□□ 1.36
TMED1-201ENST00000214869 NEO1Q92859 1461 aa23.56■■□□□ 1.36
TMED1-201ENST00000214869 NAIPQ13075 1403 aa23.55■■□□□ 1.36
TMED1-201ENST00000214869 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
TMED1-201ENST00000214869 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.52■■□□□ 1.36
TMED1-201ENST00000214869 NCOA1Q15788 1441 aa23.51■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.51■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 ADGRL1O94910 1474 aa23.51■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.5■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 TSPY4P0CV99 314 aa23.49■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 TSPY10P0CW01 314 aa23.49■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.48■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.48■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.48■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 PLXNC1O60486 1568 aa23.47■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.46■■□□□ 1.35
TMED1-201ENST00000214869 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.44■■□□□ 1.34
TMED1-201ENST00000214869 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.44■■□□□ 1.34
TMED1-201ENST00000214869 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TMED1-201ENST00000214869 TSPOAP1O95153 1857 aa23.43■■□□□ 1.34
TMED1-201ENST00000214869 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.43■■□□□ 1.34
TMED1-201ENST00000214869 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TMED1-201ENST00000214869 KDM5CP41229 1560 aa23.41■■□□□ 1.34
TMED1-201ENST00000214869 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.41■■□□□ 1.34
TMED1-201ENST00000214869 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.4■■□□□ 1.34
TMED1-201ENST00000214869 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.4■■□□□ 1.34
TMED1-201ENST00000214869 KDM6BO15054 1643 aa23.39■■□□□ 1.33
TMED1-201ENST00000214869 RICTORQ6R327 1708 aa23.38■■□□□ 1.33
TMED1-201ENST00000214869 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TMED1-201ENST00000214869 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TMED1-201ENST00000214869 KIF15Q9NS87 1388 aa23.36■■□□□ 1.33
TMED1-201ENST00000214869 ATP7AQ04656 1500 aa23.36■■□□□ 1.33
TMED1-201ENST00000214869 AFAP1Q8N556 730 aa23.35■■□□□ 1.33
TMED1-201ENST00000214869 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TMED1-201ENST00000214869 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.34■■□□□ 1.33
TMED1-201ENST00000214869 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.34■■□□□ 1.33
TMED1-201ENST00000214869 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.34■■□□□ 1.33
TMED1-201ENST00000214869 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.33■■□□□ 1.33
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TMED1-201ENST00000214869 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.31■■□□□ 1.32
TMED1-201ENST00000214869 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.3■■□□□ 1.32
TMED1-201ENST00000214869 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.29■■□□□ 1.32
TMED1-201ENST00000214869 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.28■■□□□ 1.32
TMED1-201ENST00000214869 ERBINQ96RT1 1412 aa23.27■■□□□ 1.32
TMED1-201ENST00000214869 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.23■■□□□ 1.31
TMED1-201ENST00000214869 UNC13BO14795 1591 aa23.23■■□□□ 1.31
TMED1-201ENST00000214869 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TMED1-201ENST00000214869 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.22■■□□□ 1.31
TMED1-201ENST00000214869 RAPGEF3O95398 923 aa23.21■■□□□ 1.31
TMED1-201ENST00000214869 ABCA6Q8N139 1617 aa23.2■■□□□ 1.3
TMED1-201ENST00000214869 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TMED1-201ENST00000214869 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
TMED1-201ENST00000214869 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.18■■□□□ 1.3
TMED1-201ENST00000214869 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.17■■□□□ 1.3
TMED1-201ENST00000214869 DEPDC5O75140 1603 aa23.17■■□□□ 1.3
TMED1-201ENST00000214869 PZPP20742 1482 aa23.17■■□□□ 1.3
TMED1-201ENST00000214869 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
TMED1-201ENST00000214869 A2MP01023 1474 aa23.16■■□□□ 1.3
TMED1-201ENST00000214869 TRIM52Q96A61 297 aa23.14■■□□□ 1.3
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