RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 MAP4K1Q92918 833 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 STMN2Q93045 179 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PIGSQ96S52 555 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 DISC1Q9NRI5 854 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 IFNB1P01574 187 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 NACC1Q96RE7 527 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 STAP2Q9UGK3 403 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 RPS6KA4O75676 772 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 SUSD4Q5VX71 490 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 C21orf2O43822 256 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PTPREP23469 700 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 CUEDC2Q9H467 287 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 GAP43P17677 238 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 FAM160B2Q86V87 743 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 NOL3O60936 208 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 MYL7Q01449 175 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PALM2Q8IXS6 379 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PNMA3Q9UL41 463 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 APOA5Q6Q788 366 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 AFF2P51816 1311 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PRKAB2O43741 272 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 RNF8O76064 485 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PLCB4Q15147 1175 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 NME8Q8N427 588 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 P3H4Q92791 437 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 MFAP3P55082 362 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM58Q8NG06 486 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 CEP170P1Q96L14 293 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 COX16Q9P0S2 106 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 NLRP7Q8WX94 980 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 CLIC4Q9Y696 253 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L8P0C7I0 530 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 BPIFB4P59827 614 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PTK2Q05397 1052 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 AK8Q96MA6 479 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 MTMR6Q9Y217 621 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PFDN6O15212 129 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 MECOMQ03112 1051 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 ACCSQ96QU6 501 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF827Q17R98 1081 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 KRT12Q99456 494 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF445P59923 1031 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 NT5C1BQ96P26 610 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 MBD5Q9P267 1494 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PGBD1Q96JS3 809 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 SNX25Q9H3E2 840 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 TBCKQ8TEA7 893 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDP1-208ENST00000613122 A6NJR5 290 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 DENND2CQ68D51 928 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 KCNK3O14649 394 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ABCD1P33897 745 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 ABCA8O94911 1581 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDP1-208ENST00000613122 SPATA1Q5VX52 437 aa22.07■■□□□ 1.12
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