RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	GRIA2	P42262	883 aa		6.34	□□□□□ -1.39
LINS1-210	ENST00000560934	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
LINS1-210	ENST00000560934	POU4F1	Q01851	419 aa		6.34	□□□□□ -1.39
LINS1-210	ENST00000560934	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		6.34	□□□□□ -1.39
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		6.34	□□□□□ -1.39
LINS1-210	ENST00000560934	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		6.34	□□□□□ -1.39
LINS1-210	ENST00000560934	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		6.34	□□□□□ -1.39
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		6.34	□□□□□ -1.39
LINS1-210	ENST00000560934	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
LINS1-210	ENST00000560934	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
LINS1-210	ENST00000560934	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
LINS1-210	ENST00000560934	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	WNT11	O96014	354 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	GSTM1	P09488	218 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	FAM153B	P0C7A2	387 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	BMP8B	P34820	402 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	PPP2R2A	P63151	447 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	AMPD2	Q01433	879 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	TEK	Q02763	1124 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	KDM6B	O15054	1643 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	KDM5C	P41229	1560 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ATP7A	Q04656	1500 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	IFNGR1	P15260	489 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	LRP8	Q14114	963 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	GGT6	Q6P531	493 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	SGSM3	Q96HU1	749 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		6.32	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	NUP155	O75694	1391 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	RICTOR	Q6R327	1708 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ATP10A	O60312	1499 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	A2M	P01023	1474 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	STXBP3	O00186	592 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF205	O95201	554 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	GRB10	Q13322	594 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	RTP2	Q5QGT7	225 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		6.31	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM82	A0PJX8	343 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	AURKA	O14965	403 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	PRODH	O43272	600 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ADCY3	O60266	1144 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	FUT4	P22083	530 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	KCNJ6	P48051	423 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	SCRN1	Q12765	414 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		6.3	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	CAPNS1	P04632	268 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	L1CAM	P32004	1257 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	ECI1	P42126	302 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	CYP4F3	Q08477	520 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LINS1-210	ENST00000560934	PLCL1	Q15111	1095 aa		6.29	□□□□□ -1.4

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