RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 RAG1P15918 1043 aa22.09■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 EDNRBP24530 442 aa22.09■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 IQCA1Q86XH1 822 aa22.09■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 GUCD1Q96NT3 240 aa22.09■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.09■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.09■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.08■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.08■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 CD4P01730 458 aa22.08■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.08■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.08■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 PNMA2Q9UL42 364 aa22.08■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.08■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 Q9Y3F1 56 aa22.08■■□□□ 1.13
CTTN-211ENST00000527622 TIMP1P01033 207 aa22.07■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 SEC23AQ15436 765 aa22.07■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.07■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.07■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.07■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.07■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 GBF1Q92538 1859 aa22.07■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 CALML3P27482 149 aa22.06■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 FPGSQ05932 587 aa22.06■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.06■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 KAT14Q9H8E8 782 aa22.06■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 CHMLP26374 656 aa22.05■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 PTH1RQ03431 593 aa22.05■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 USH1GQ495M9 461 aa22.05■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.05■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.05■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.05■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 KRT23Q9C075 422 aa22.05■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.05■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.05■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 CABYRO75952 493 aa22.04■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 MFSD5Q6N075 450 aa22.04■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.04■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 RGS22Q8NE09 1264 aa22.04■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 DNERQ8NFT8 737 aa22.04■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 TBC1D5Q92609 795 aa22.04■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.04■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 COL20A1Q9P218 1284 aa22.04■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 SCN5AQ14524 2016 aa22.04■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.03■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 CYP21A2P08686 494 aa22.03■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.03■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.03■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.03■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.03■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.03■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.03■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.03■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 PSMC6P62333 389 aa22.02■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 ITGA7Q13683 1181 aa22.02■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 RASIP1Q5U651 963 aa22.02■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 MTMR8Q96EF0 704 aa22.02■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 FAM161BQ96MY7 647 aa22.02■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.127e-33■■□□□ 13.8
CTTN-211ENST00000527622 ABCB11O95342 1321 aa22.02■■□□□ 1.12
CTTN-211ENST00000527622 OPLAHO14841 1288 aa22.01■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 SGSM2O43147 1006 aa22.01■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.01■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.01■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 MAF1Q9H063 256 aa22.01■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 TET1Q8NFU7 2136 aa22.01■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.01■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 B4GALT4O60513 344 aa22■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 ARIH2O95376 493 aa22■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 CSF2RAP15509 400 aa22■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 TMEM240Q5SV17 173 aa22■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 STOX1Q6ZVD7 989 aa22■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 SENP2Q9HC62 589 aa22■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 MAD2L2Q9UI95 211 aa22■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 TTC28Q96AY4 2481 aa21.99■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 ZEB2O60315 1214 aa21.99■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 CYP2C18P33260 490 aa21.99■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 GHRHRQ02643 423 aa21.99■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 PDE4DQ08499 809 aa21.99■■□□□ 1.11
CTTN-211ENST00000527622 COPS5Q92905 334 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms