RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
ITGA4-211ENST00000490435 RNF34Q969K3 372 aa7.59□□□□□ -1.19
ITGA4-211ENST00000490435 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.59□□□□□ -1.19
ITGA4-211ENST00000490435 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.59□□□□□ -1.19
ITGA4-211ENST00000490435 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.59□□□□□ -1.19
ITGA4-211ENST00000490435 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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ITGA4-211ENST00000490435 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.56□□□□□ -1.2
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ITGA4-211ENST00000490435 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.55□□□□□ -1.2
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ITGA4-211ENST00000490435 ZBTB7AO95365 584 aa7.54□□□□□ -1.2
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ITGA4-211ENST00000490435 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ITGA4-211ENST00000490435 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.54□□□□□ -1.2
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.54□□□□□ -1.2
ITGA4-211ENST00000490435 NOX5Q96PH1 765 aa7.54□□□□□ -1.2
ITGA4-211ENST00000490435 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.54□□□□□ -1.2
ITGA4-211ENST00000490435 CBFA2T2O43439 604 aa7.53□□□□□ -1.2
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ITGA4-211ENST00000490435 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
ITGA4-211ENST00000490435 PPT2Q9UMR5 302 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF76P36508 570 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 SEPHS1P49903 392 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 USP33Q8TEY7 942 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.52□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
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ITGA4-211ENST00000490435 MTA3Q9BTC8 594 aa7.51□□□□□ -1.21
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ITGA4-211ENST00000490435 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.51□□□□□ -1.21
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ITGA4-211ENST00000490435 ZXDAP98168 799 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 GNPTABQ3T906 1256 aa7.5□□□□□ -1.21
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ITGA4-211ENST00000490435 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.5□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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ITGA4-211ENST00000490435 GULP1Q9UBP9 304 aa7.5□□□□□ -1.21
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ITGA4-211ENST00000490435 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 VAMP4O75379 141 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 PPM1BO75688 479 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 CYP2C8P10632 490 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 PAMP19021 973 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 CPZQ66K79 652 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 DDX11Q96FC9 970 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 SAMD11Q96NU1 681 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 CRBNQ96SW2 442 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 AMPD2Q01433 879 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 LOXL4Q96JB6 756 aa7.48□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.47□□□□□ -1.21
ITGA4-211ENST00000490435 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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