RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GUCY2CP25092 1073 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CORO7P57737 925 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 VMACQ2NL98 169 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 JAMLQ86YT9 394 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PWWP2AQ96N64 755 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYBBP04839 570 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DBHP09172 617 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PFKLP17858 780 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NCKAP1LP55160 1127 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FIBCD1Q8N539 461 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A087WZG4 1122 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FBLN1P23142 703 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SDE2Q6IQ49 451 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BRF1Q92994 677 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ITGA4P13612 1032 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SOX9P48436 509 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TEPSINQ96N21 525 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMX1Q9H3N1 280 aa7.18□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TBC1D8O95759 1140 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POU4F1Q01851 419 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYT8Q8NBV8 401 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PPT2Q9UMR5 302 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TBX22Q9Y458 520 aa7.17□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FFAR3O14843 346 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CBFA2T2O43439 604 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IFNGR1P15260 489 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LIMS1P48059 325 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TNNI3KQ59H18 835 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BICRALQ6AI39 1079 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNF38Q9H0F5 515 aa7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PQJ5 194 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD3EP07766 207 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CELA3BP08861 270 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HSD3B2P26439 372 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 L1CAMP32004 1257 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TCEAL1Q15170 157 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 VWA3BQ502W6 1294 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GINM1Q9NU53 330 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WHRNQ9P202 907 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNC1P48547 511 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLURP1P55000 103 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HTRA3P83110 453 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRR5P85299 388 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FOXO4P98177 505 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SERINC3Q13530 473 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRBNQ96SW2 442 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HAUS7Q99871 368 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PIF1Q9H611 641 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 JAG2Q9Y219 1238 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 F8W031 263 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AURKAO14965 403 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GLI4P10075 376 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms