RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRIT1O00522 736 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 MTX1Q13505 466 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 CASP8Q14790 479 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 ASIC2Q16515 512 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 MBIPQ9NS73 344 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 NSD2O96028 1365 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 GNGT2O14610 69 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 KCNA2P16389 499 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 DEFA1P59665 94 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 DEFA3P59666 94 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 EMC3Q9P0I2 261 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 SMAPO00193 183 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 E2F6O75461 281 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 IGHDP01880 384 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 GSTA2P09210 222 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 NLRP12P59046 1061 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 RGL1Q9NZL6 768 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF839A8K0R7 811 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 AP1B1Q10567 949 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TERB1Q8NA31 727 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 HIC2Q96JB3 615 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 PTCH1Q13635 1447 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TSPY2A6NKD2 308 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TSPY3P0CV98 308 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TSPY8P0CW00 308 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TSPY1Q01534 308 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 IP6K1Q92551 441 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 CYTH2Q99418 400 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 P4HA2O15460 535 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 CYP27B1O15528 508 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 SASH1O94885 1247 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 LCA5LO95447 670 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 VCAM1P19320 739 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 S100A5P33763 92 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 MAP3K10Q02779 954 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 SUPT3HO75486 399 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 MBD2Q9UBB5 411 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 NUP205Q92621 2012 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 RAD23BP54727 409 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC20A2Q08357 652 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 BIRC3Q13489 604 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC103Q8IW40 242 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 PSMB7Q99436 277 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TLK1Q9UKI8 766 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 EXOC5O00471 708 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 OGFOD1Q8N543 542 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 CATSPER2Q96P56 530 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 ALG1Q9BT22 464 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 AMFRQ9UKV5 643 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRZ1-201ENST00000393386 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms