RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 MORC4Q8TE76 937 aa24.83■■□□□ 1.57
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.83■■□□□ 1.57
SOCS1-201ENST00000332029 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.82■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.82■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 PBX4Q9BYU1 374 aa24.82■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 HIPK3Q9H422 1215 aa24.82■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 IL23AQ9NPF7 189 aa24.82■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.82■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 GRIN2DO15399 1336 aa24.82■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 GRXCR1A8MXD5 290 aa24.81■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 HIP1O00291 1037 aa24.81■■□□□ 1.56
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SOCS1-201ENST00000332029 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
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SOCS1-201ENST00000332029 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
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SOCS1-201ENST00000332029 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.8■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF213O14771 459 aa24.79■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 PSMC6P62333 389 aa24.79■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 HERVK_113Q902F9 699 aa24.79■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.79■■□□□ 1.56
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SOCS1-201ENST00000332029 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.78■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.78■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 B4GALT4O60513 344 aa24.78■■□□□ 1.56
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SOCS1-201ENST00000332029 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
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SOCS1-201ENST00000332029 ESR2Q92731 530 aa24.78■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
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SOCS1-201ENST00000332029 FGBP02675 491 aa24.77■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 CCL23P55773 120 aa24.77■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.77■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 USP38Q8NB14 1042 aa24.77■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.77■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.77■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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SOCS1-201ENST00000332029 NEDD4P46934 1319 aa24.77■■□□□ 1.56
SOCS1-201ENST00000332029 CALML3P27482 149 aa24.76■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF543Q08ER8 600 aa24.75■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 RAB30Q15771 203 aa24.75■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.75■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.75■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.75■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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SOCS1-201ENST00000332029 MSRAQ9UJ68 235 aa24.75■■□□□ 1.55
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SOCS1-201ENST00000332029 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.74■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.74■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.74■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.73■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 SNHG28P0DPA3 235 aa24.73■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 PDE4AP27815 886 aa24.73■■□□□ 1.55
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SOCS1-201ENST00000332029 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.73■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.73■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 MYL3P08590 195 aa24.72■■□□□ 1.55
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SOCS1-201ENST00000332029 PDE4DQ08499 809 aa24.72■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.72■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 IQCA1Q86XH1 822 aa24.72■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.72■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 KDM4AO75164 1064 aa24.71■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.71■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 EDNRBP24530 442 aa24.71■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 PPP2R5BQ15173 497 aa24.71■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 DNERQ8NFT8 737 aa24.71■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 SCLYQ96I15 445 aa24.71■■□□□ 1.55
SOCS1-201ENST00000332029 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
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SOCS1-201ENST00000332029 RAD50Q92878 1312 aa24.7■■□□□ 1.54
SOCS1-201ENST00000332029 B4E1Z4 1266 aa24.7■■□□□ 1.54
SOCS1-201ENST00000332029 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
SOCS1-201ENST00000332029 CYP2C9P11712 490 aa24.7■■□□□ 1.54
SOCS1-201ENST00000332029 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SOCS1-201ENST00000332029 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SOCS1-201ENST00000332029 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SOCS1-201ENST00000332029 TTC22Q5TAA0 569 aa24.7■■□□□ 1.54
SOCS1-201ENST00000332029 PPM1EQ8WY54 764 aa24.7■■□□□ 1.54
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