RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292538.8

CUX1-202, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 2,930 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-202ENST00000292538 SLC30A10Q6XR72 485 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 SYT10Q6XYQ8 523 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 NIM1KQ8IY84 436 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 MYRIPQ8NFW9 859 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 POLD4Q9HCU8 107 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 RIC8AQ9NPQ8 531 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 TBC1D7Q9P0N9 293 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 SPDYE2BA6NHP3 402 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 SPDYE6P0CI01 402 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 STAT3P40763 770 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 NBPF9Q3BBW0 867 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 PRR16Q569H4 304 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 CCDC112Q8NEF3 446 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 PRIMPOLQ96LW4 560 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 EHD4Q9H223 541 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 MYH1P12882 1939 aa12.9□□□□□ -0.34
CUX1-202ENST00000292538 LAD1O00515 517 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 KRT79Q5XKE5 535 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 RTKN2Q8IZC4 609 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 PCDHA12Q9UN75 941 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 BMP3P12645 472 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 NOVP48745 357 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 RBL2Q08999 1139 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 STK4Q13043 487 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 KRT31Q15323 416 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 BCS1LQ9Y276 419 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 GJA3Q9Y6H8 435 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 KCNJ18B7U540 433 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 CFBP00751 764 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 SMARCA1P28370 1054 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 UBXN1Q04323 297 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 STIM1Q13586 685 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 KCNJ12Q14500 433 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 MTF1Q14872 753 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 NR1I3Q14994 352 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 LRRC41Q15345 812 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 FAM83BQ5T0W9 1011 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 SV2BQ7L1I2 683 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 CCSER1Q9C0I3 900 aa12.89□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 ZNF76P36508 570 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 FBXO11Q86XK2 927 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 NYAP2Q9P242 653 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 SPDYE3A6NKU9 549 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 MEIS1O00470 390 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 PSMA7O14818 248 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 EDIL3O43854 480 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 CASP14P31944 242 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 PRPHP41219 470 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 SYDE2Q5VT97 1194 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 TATDN1Q6P1N9 297 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 KCNK18Q7Z418 384 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 JDP2Q8WYK2 163 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 RAB34Q9BZG1 259 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 TRIM9Q9C026 710 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 DNAI1Q9UI46 699 aa12.88□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 PLIN4Q96Q06 1357 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 ESYT2A0FGR8 921 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 SOWAHDA6NJG2 315 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 KCNA3P22001 575 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 TBC1D5Q92609 795 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 AK8Q96MA6 479 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 FEZ1Q99689 392 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 AMNQ9BXJ7 453 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 ANO3Q9BYT9 981 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 KBTBD4Q9NVX7 518 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 RWDD2AQ9UIY3 292 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 CXCL9Q07325 125 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 GRB10Q13322 594 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 DGKZQ13574 1117 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 ECM1Q16610 540 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 TC2NQ8N9U0 490 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 CYP2W1Q8TAV3 490 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 MTMR9Q96QG7 549 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 FBXO28Q9NVF7 368 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 KIAA1024Q9UPX6 916 aa12.87□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 A0A1B0GTH6 734 aa12.86□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 MYMKA6NI61 221 aa12.86□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 MYO1BO43795 1136 aa12.86□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 EGFRP00533 1210 aa12.86□□□□□ -0.35
CUX1-202ENST00000292538 AMPD3Q01432 767 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms