RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264266.12

MFSD1-201, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MFSD1, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-201ENST00000264266 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 SH2D4AQ9H788 454 aa21.51■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 VCPKMTQ9H867 229 aa21.51■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 GOPCQ9HD26 462 aa21.51■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 PEX10O60683 326 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 ATP2B1P20020 1258 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 PTPREP23469 700 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 TTC38Q5R3I4 469 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.5■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 CAP1Q01518 475 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 TNMDQ9H2S6 317 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 PNMA3Q9UL41 463 aa21.49■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 A0A1B0GVL5 298 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 COA7Q96BR5 231 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 TMEM232C9JQI7 657 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 KINO60870 393 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 FKTNO75072 461 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 RESP18Q5W5W9 173 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 SHC4Q6S5L8 630 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 TSPY26PQ9H489 355 aa21.48■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 CTAGE5O15320 804 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 OSBPP22059 807 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 NDUFA8P51970 172 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF174Q15697 407 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 PARP14Q460N5 1801 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 C17orf99Q6UX52 265 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 HPSEQ9Y251 543 aa21.47■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 WNT7AO00755 349 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 ADCY7P51828 1080 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 SP3Q02447 781 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 CAMK4Q16566 473 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 LPAR1Q92633 364 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 CLIC6Q96NY7 704 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 HTTP42858 3142 aa21.46■■□□□ 1.03
MFSD1-201ENST00000264266 RLFQ13129 1914 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 USP17L15C9J2P7 530 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 USP17L11C9JVI0 530 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 USP17L18D6R9N7 530 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 USP17L22D6RA61 530 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 USP17L19D6RCP7 530 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 USP17L20D6RJB6 530 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 PLA2G6O60733 806 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 BCRP11274 1271 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 PFKFB1P16118 471 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 HERVK_113P62684 666 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 USP17L24Q0WX57 530 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.45■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 FERMT2Q96AC1 680 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 RBSNQ9H1K0 784 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF202O95125 648 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 STAT2P52630 851 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 INF2Q27J81 1249 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 TIGD1Q96MW7 591 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.44■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.43■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 FLOT1O75955 427 aa21.43■■□□□ 1.02
MFSD1-201ENST00000264266 CTGFP29279 349 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms