RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 SRGAP2O75044 1071 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 CXCR5P32302 372 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 GIMAP4Q9NUV9 329 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 GALNT8Q9NY28 637 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 L1RE1Q9UN81 338 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 TBX22Q9Y458 520 aa11.64□□□□□ -0.55
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KPNA3-201ENST00000261667 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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KPNA3-201ENST00000261667 PPP2R2AP63151 447 aa11.63□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.63□□□□□ -0.55
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KPNA3-201ENST00000261667 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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KPNA3-201ENST00000261667 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 ATP6V1G2O95670 118 aa11.63□□□□□ -0.55
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KPNA3-201ENST00000261667 CCDC159P0C7I6 412 aa11.63□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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KPNA3-201ENST00000261667 MSANTD4Q8NCY6 345 aa11.63□□□□□ -0.55
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KPNA3-201ENST00000261667 ZNF827Q17R98 1081 aa11.62□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.62□□□□□ -0.55
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KPNA3-201ENST00000261667 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.62□□□□□ -0.55
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KPNA3-201ENST00000261667 PRELID1Q9Y255 219 aa11.61□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.61□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.61□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.61□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.61□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 TSPAN9O75954 239 aa11.61□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 ATP5JP18859 108 aa11.61□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 KRT80Q6KB66 452 aa11.61□□□□□ -0.55
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