RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM83G	A6ND36	823 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB6A	P20340	208 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	L1CAM	P32004	1257 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	NTF4	P34130	210 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	EXOC2	Q96KP1	924 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		6.27	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PLD2	O14939	933 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	NFIC	P08651	508 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SDS	P20132	328 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	RXRB	P28702	533 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	DGKH	Q86XP1	1220 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	E2F7	Q96AV8	911 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MTMR8	Q96EF0	704 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	RAX	Q9Y2V3	346 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ADGRL1	O94910	1474 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		6.26	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	F2	P00734	622 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPY4	P0CV99	314 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPY10	P0CW01	314 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	CCNF	P41002	786 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ITK	Q08881	620 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MORC3	Q14149	939 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	BEND4	Q6ZU67	534 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ISL2	Q96A47	359 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCC1	P33527	1531 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	E2F8	A0AVK6	867 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GUCY2C	P25092	1073 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GRK4	P32298	578 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	STRN3	Q13033	797 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP7	Q14244	749 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXO41	Q8TF61	875 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	PPCS	Q9HAB8	311 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	STOML1	Q9UBI4	398 aa		6.25	□□□□□ -1.41
EFHC1-223	ENST00000636616	SWAP70	Q9UH65	585 aa		6.25	□□□□□ -1.41

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