RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 BTBD7Q9P203 1132 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 PLXNB2O15031 1838 aa9.84□□□□□ -0.83
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF536O15090 1300 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 MGAMO43451 1857 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 STK25O00506 426 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CNMDO75829 334 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ICAM1P05362 532 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 SCG2P13521 617 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 FOSBP53539 338 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 OAZ1P54368 228 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CRHR2Q13324 411 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PKN1Q16512 942 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO11Q86XK2 927 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 WASF1Q92558 559 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 COA7Q96BR5 231 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 AIFM3Q96NN9 605 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 AMNQ9BXJ7 453 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CPA4Q9UI42 421 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.83□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ADGRA2Q96PE1 1338 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CA12O43570 354 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 TLR2O60603 784 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 TRPA1O75762 1119 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 TBC1D8O95759 1140 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ALAS1P13196 640 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 STAT3P40763 770 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ERVK-9P63128 1117 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ERVK-24P63145 666 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ALG1Q9BT22 464 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 RNF186Q9NXI6 227 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 STK24Q9Y6E0 443 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ABCB11O95342 1321 aa9.82□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PCNTO95613 3336 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 STXBP3O00186 592 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ATP2A1O14983 1001 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 XBP1P17861 261 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 NAPAP54920 295 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 TRAF1Q13077 416 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 Q3C1V9 767 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 BARHL2Q9NY43 387 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PNMA2Q9UL42 364 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 KIF3AQ9Y496 699 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CEP350Q5VT06 3117 aa9.81□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A27O95847 323 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 BCRP11274 1271 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 ERCC3P19447 782 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CCNA1P78396 465 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM29Q14134 588 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 TKFCQ3LXA3 575 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 WDR78Q5VTH9 848 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 C17orf99Q6UX52 265 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 SHISA4Q96DD7 197 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 C8orf76Q96K31 380 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SGMS1-211ENST00000626236 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms