RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591545.5

SMARCA4-216, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SMARCA4, Length 5,193 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4-216ENST00000591545 ZMYM6O95789 1325 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ASNSP08243 561 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 LIG4P49917 911 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 TFDP1Q14186 410 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.65□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 CEP104O60308 925 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 FAM160B2Q86V87 743 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 NELFBQ8WX92 580 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 BCRP11274 1271 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 VSIG1Q86XK7 387 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 SYNE4Q8N205 404 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 IGSF3O75054 1194 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 E7EVH7 732 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 GRIN3BO60391 1043 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 GPBP1Q86WP2 473 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 TRIM58Q8NG06 486 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.64□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 OR52Z1P0C646 297 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 ADD2P35612 726 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 NT5C2P49902 561 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 STAT2P52630 851 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 HHATQ5VTY9 493 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 H7C1W4 665 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 IGBP1P78318 339 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 MTX1Q13505 466 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 HLFQ16534 295 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 CCDC125Q86Z20 511 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 SORBS3O60504 671 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 TNNC2P02585 160 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 VCXQ9H320 206 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.63□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 RASSF2P50749 326 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 ITIH3Q06033 890 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 RETREG2Q8NC44 543 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 ECE2O60344 883 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 JAK2O60674 1132 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 PPP2R5AQ15172 486 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 PEX26Q7Z412 305 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 CCT6BQ92526 530 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 KIF3CO14782 793 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMARCA4-216ENST00000591545 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms