RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CD4P01730 458 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ACRP10323 421 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PBX2P40425 430 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CTDSPL2Q05D32 466 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TKFCQ3LXA3 575 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL17Q6UXB2 119 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TLK2Q86UE8 772 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM199Q8N511 208 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 USP38Q8NB14 1042 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB14A6NK59 587 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPY2A6NKD2 308 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TLR3O15455 904 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G6O60733 806 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 MUM1L1Q5H9M0 696 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PBX4Q9BYU1 374 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR12Q9ULL5 1215 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC37A2A6NM11 1700 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2C18P33260 490 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 RCSD1Q6JBY9 416 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF365Q70YC5 407 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SMPD1P17405 629 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 MX1P20591 662 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC43A3Q8NBI5 491 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PDGFCQ9NRA1 345 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP39A1Q9NYL5 469 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM63BQ5T3F8 832 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 EEPD1Q7L9B9 569 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 MTMR7Q9Y216 660 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS53Q5VIR6 699 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TAPT1Q6NXT6 567 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIN2DO15399 1336 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 UMODL1Q5DID0 1318 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SALL3Q9BXA9 1300 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA7Q13683 1181 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 AP5M1Q9H0R1 490 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 IL23AQ9NPF7 189 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CCPG1Q9ULG6 757 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CABYRO75952 493 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 NOVP48745 357 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 NSMFQ6X4W1 530 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 HIPK3Q9H422 1215 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 HERVK_113Q902F9 699 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ANAPC4Q9UJX5 808 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ICAM1P05362 532 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMC6P62333 389 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC96Q2M329 555 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 IQSEC1Q6DN90 963 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM12Q9H4Q4 367 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC16A2P36021 539 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TTBK2Q6IQ55 1244 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MORC4Q8TE76 937 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF4Q8WV16 495 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPV6Q9H1D0 765 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM6Q9NQX0 595 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 Q9Y3F1 56 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ORC4O43929 436 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ZEB2O60315 1214 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GALT4O60513 344 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 VTA1Q9NP79 307 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 LCTP09848 1927 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL23P55773 120 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT8AQ9H1J5 351 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 NFIBO00712 420 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 FGBP02675 491 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 FGRP09769 529 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 BTNL9Q6UXG8 535 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB30Q15771 203 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TJAP1Q5JTD0 557 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 OTOP2Q7RTS6 562 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PPM1EQ8WY54 764 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 EVI5LQ96CN4 794 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MSRAQ9UJ68 235 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRE1Q14246 886 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ALX1Q15699 326 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SYDE2Q5VT97 1194 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM47Q9BQJ4 181 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TOMM22Q9NS69 142 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP28Q4G0W2 176 aa30.26■■■□□ 2.43
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