RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 SPC25Q9HBM1 224 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 MTMR7Q9Y216 660 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 CTAGE5O15320 804 aa21.54■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 NT5C2P49902 561 aa21.54■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 FAAP100Q0VG06 881 aa21.54■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.54■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.54■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.54■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.54■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 ASGR1P07306 291 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 SNHG28P0DPA3 235 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 PDHBP11177 359 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 SLC16A2P36021 539 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 CDK7P50613 346 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 MORC4Q8TE76 937 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.52■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 TNFAIP2Q03169 654 aa21.52■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.52■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTIF-206ENST00000588345 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.52■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 HIP1O00291 1037 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 RAG1P15918 1043 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 ZNF543Q08ER8 600 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 GNASQ5JWF2 1037 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 NSMFQ6X4W1 530 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 ESR2Q92731 530 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 TBX21Q9UL17 535 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 PNMA2Q9UL42 364 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 NEDD4P46934 1319 aa21.51■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 COL6A3P12111 3177 aa21.5■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.5■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 ZNF213O14771 459 aa21.5■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.5■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 DGKHQ86XP1 1220 aa21.5■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.5■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.5■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 ARVCFO00192 962 aa21.49■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 EPHB4P54760 987 aa21.49■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.49■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.49■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 VTA1Q9NP79 307 aa21.49■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 Q9Y3F1 56 aa21.49■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 NFIBO00712 420 aa21.48■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 SMPD1P17405 629 aa21.48■■□□□ 1.03
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CTIF-206ENST00000588345 FPGSQ05932 587 aa21.48■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 TLK2Q86UE8 772 aa21.48■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.48■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.48■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 TIMP1P01033 207 aa21.47■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.47■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.47■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.47■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.47■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 ANKS1AQ92625 1134 aa21.47■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 GUCD1Q96NT3 240 aa21.47■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 CABYRO75952 493 aa21.46■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.46■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.46■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.46■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.46■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.46■■□□□ 1.03
CTIF-206ENST00000588345 KDM4AO75164 1064 aa21.45■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 CD4P01730 458 aa21.45■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 MFSD5Q6N075 450 aa21.45■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.45■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 IQCA1Q86XH1 822 aa21.45■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 PTGS1P23219 599 aa21.44■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.44■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.44■■□□□ 1.02
CTIF-206ENST00000588345 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.44■■□□□ 1.02
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