RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 CD4P01730 458 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 DNAJB2P25686 324 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.775e-19■□□□□ 10.3
E2F4-210ENST00000568485 ALX1Q15699 326 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 TMEM240Q5SV17 173 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 TLK2Q86UE8 772 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 SLC43A3Q8NBI5 491 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 FOSL2P15408 326 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 CSF2RAP15509 400 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 PTGS1P23219 599 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 RASIP1Q5U651 963 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 DCAF4Q8WV16 495 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 UNC80Q8N2C7 3258 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 SMPD1P17405 629 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 TAPT1Q6NXT6 567 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 CXCL17Q6UXB2 119 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 PDGFCQ9NRA1 345 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 CCPG1Q9ULG6 757 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-210ENST00000568485 LCTP09848 1927 aa26.08■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 TLR3O15455 904 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 ICAM1P05362 532 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 PDE1AP54750 535 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 GRIN2CQ14957 1233 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 TMEM199Q8N511 208 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 MORC4Q8TE76 937 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 MTMR7Q9Y216 660 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 CABYRO75952 493 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 CCDC96Q2M329 555 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 TMEM63BQ5T3F8 832 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 NSMFQ6X4W1 530 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 FAM227BQ96M60 508 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 GRIN2DO15399 1336 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 A0A0D9SFI3 127 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 FGAP02671 866 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 IQSEC1Q6DN90 963 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 EEPD1Q7L9B9 569 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 TIFAQ96CG3 184 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 Q9Y3F1 56 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 CUL9Q8IWT3 2517 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 CDH23Q9H251 3354 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 ACRP10323 421 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 CYP2C18P33260 490 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 SLC16A2P36021 539 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 ITGA7Q13683 1181 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 ZNF365Q70YC5 407 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 CRBNQ96SW2 442 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 AP5M1Q9H0R1 490 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 ZNF576Q9H609 170 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 VTA1Q9NP79 307 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 ZMYM6O95789 1325 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.03■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.03■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 PBX4Q9BYU1 374 aa26.03■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 GRXCR1A8MXD5 290 aa26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 NFIBO00712 420 aa26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 PBX2P40425 430 aa26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 TICAM2Q86XR7 235 aa26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 IL23AQ9NPF7 189 aa26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 TOMM22Q9NS69 142 aa26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 UMODL1Q5DID0 1318 aa26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 EYSQ5T1H1 3165 aa26.02■■□□□ 1.76
E2F4-210ENST00000568485 ZEB2O60315 1214 aa26.01■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.01■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa26.01■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 HIPK3Q9H422 1215 aa26.01■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 B4GALT4O60513 344 aa26■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 PDHBP11177 359 aa26■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 DUSP28Q4G0W2 176 aa26■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 USP38Q8NB14 1042 aa26■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 HERVK_113Q902F9 699 aa26■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.99■■□□□ 1.75
E2F4-210ENST00000568485 PSMC6P62333 389 aa25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms