RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-222ENST00000533557 ARNTL2Q8WYA1 636 aa14.6□□□□□ -0.07
BBS1-222ENST00000533557 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
BBS1-222ENST00000533557 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.6□□□□□ -0.07
BBS1-222ENST00000533557 NYAP2Q9P242 653 aa14.6□□□□□ -0.07
BBS1-222ENST00000533557 COG5Q9UP83 839 aa14.6□□□□□ -0.07
BBS1-222ENST00000533557 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.6□□□□□ -0.07
BBS1-222ENST00000533557 MYH8P13535 1937 aa14.59□□□□□ -0.07
BBS1-222ENST00000533557 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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BBS1-222ENST00000533557 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
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BBS1-222ENST00000533557 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.52□□□□□ -0.09
BBS1-222ENST00000533557 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.52□□□□□ -0.09
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BBS1-222ENST00000533557 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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BBS1-222ENST00000533557 PTPRSQ13332 1948 aa14.51□□□□□ -0.09
BBS1-222ENST00000533557 MYL3P08590 195 aa14.51□□□□□ -0.09
BBS1-222ENST00000533557 ALAS1P13196 640 aa14.51□□□□□ -0.09
BBS1-222ENST00000533557 IL9P15248 144 aa14.51□□□□□ -0.09
BBS1-222ENST00000533557 DEFB103AP81534 67 aa14.51□□□□□ -0.09
BBS1-222ENST00000533557 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.51□□□□□ -0.09
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