RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487591.5

RRM2-208, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-208	ENST00000487591	SMPD1	P17405	629 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	BCL11A	Q9H165	835 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	SH2D4A	Q9H788	454 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TNFAIP2	Q03169	654 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TAP1	Q03518	808 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	KIFC2	Q96AC6	838 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	GOPC	Q9HD26	462 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	COPB2	P35606	906 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	SNAP25	P60880	206 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	CCDC174	Q6PII3	467 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TLK2	Q86UE8	772 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	NYAP2	Q9P242	653 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	MYO7A	Q13402	2215 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	LCHN	A4D1U4	455 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	PRDM1	O75626	825 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	GRB10	Q13322	594 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	GPNMB	Q14956	572 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TCTN1	Q2MV58	587 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	IL27	Q8NEV9	243 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	PANK1	Q8TE04	598 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ANKS1A	Q92625	1134 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	CEP95	Q96GE4	821 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	SPC25	Q9HBM1	224 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	GPR37L1	O60883	481 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ZBED4	O75132	1171 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ATP5J	P18859	108 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	UBE3C	Q15386	1083 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	SBK1	Q52WX2	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	MKL1	Q969V6	931 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	HAUS7	Q99871	368 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		10.4	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	CABYR	O75952	493 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	OSBP2	Q969R2	916 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	TNKS	O95271	1327 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RRM2-208	ENST00000487591	TMEM232	C9JQI7	657 aa		10.38	□□□□□ -0.75

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