RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477447.6

TARDBP-208, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-208	ENST00000477447	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	COPS5	Q92905	334 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	CP	P00450	1065 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	FGFR1	P11362	822 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	PAM	P19021	973 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	CHRNE	Q04844	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC14A2	Q15849	920 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	JAML	Q86YT9	394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	DLX3	O60479	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	HPX	P02790	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	CAPNS1	P04632	268 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	SCG5	P05408	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	L1CAM	P32004	1257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	RTP1	P59025	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A1W2PQY0	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	BLACE	A4D250	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	AFM	P43652	599 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A1W2PQ27	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A1W2PQ64	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A1W2PQC6	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A1W2PQD8	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NRDC	O43847	1150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	PSPN	O60542	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	GALK1	P51570	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	IRAK1	P51617	712 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NR0B2	Q15466	257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	NTRK3	Q16288	839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	INF2	Q27J81	1249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-208	ENST00000477447	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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