RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 DDX11Q96FC9 970 aa22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 RNF146Q9NTX7 359 aa22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.56■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 JAK2O60674 1132 aa22.56■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 FKTNO75072 461 aa22.56■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 COPB2P35606 906 aa22.56■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 KIF22Q14807 665 aa22.56■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 TKFCQ3LXA3 575 aa22.56■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.56■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.29e-7■■■□□ 16.4
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SNHG12-201ENST00000461448 ABCB11O95342 1321 aa22.55■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 FOXN1O15353 648 aa22.55■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 SCG2P13521 617 aa22.55■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 XBP1P17861 261 aa22.55■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 MAPK4P31152 587 aa22.55■■□□□ 1.2
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SNHG12-201ENST00000461448 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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SNHG12-201ENST00000461448 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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SNHG12-201ENST00000461448 CHST13Q8NET6 341 aa22.54■■□□□ 1.2
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SNHG12-201ENST00000461448 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 ACAD9Q9H845 621 aa22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 FBXO40Q9UH90 709 aa22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 PDCP20941 246 aa22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 FCGRTP55899 365 aa22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 ERO1AQ96HE7 468 aa22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.53■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 GPR142Q7Z601 462 aa22.52■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.52■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 BARHL2Q9NY43 387 aa22.52■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 NFIBO00712 420 aa22.51■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 CTGFP29279 349 aa22.51■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 NAPAP54920 295 aa22.51■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 TRIM29Q14134 588 aa22.51■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 RGS22Q8NE09 1264 aa22.51■■□□□ 1.19
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SNHG12-201ENST00000461448 ALG1Q9BT22 464 aa22.51■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.51■■□□□ 1.19
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SNHG12-201ENST00000461448 FCER1AP12319 257 aa22.5■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 KCTD2Q14681 263 aa22.5■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 NSMFQ6X4W1 530 aa22.5■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.5■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.5■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 TRIM47Q96LD4 638 aa22.5■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 MYH6P13533 1939 aa22.5■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 PTPREP23469 700 aa22.49■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.49■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.49■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.49■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 STRNO43815 780 aa22.49■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 LBX1P52954 281 aa22.49■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF6Q15052 776 aa22.49■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.49■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.49■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 PCNTO95613 3336 aa22.48■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 CFBP00751 764 aa22.48■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 FOSBP53539 338 aa22.48■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 CAP1Q01518 475 aa22.48■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 TBC1D5Q92609 795 aa22.48■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 C8orf76Q96K31 380 aa22.48■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.48■■□□□ 1.19
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SNHG12-201ENST00000461448 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.47■■□□□ 1.19
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SNHG12-201ENST00000461448 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.47■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.47■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.47■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 MAF1Q9H063 256 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 H3BQV1 296 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 POLR2MP0CAP2 368 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 CALML3P27482 149 aa22.46■■□□□ 1.19
SNHG12-201ENST00000461448 HOXD10P28358 340 aa22.46■■□□□ 1.19
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