RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ASTN1O14525 1302 aa24.73■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 IGHDP01880 384 aa24.73■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 ITGB8P26012 769 aa24.73■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 FAAP100Q0VG06 881 aa24.73■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 SHHQ15465 462 aa24.73■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.73■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.73■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.73■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.73■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.72■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.72■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 ASGR1P07306 291 aa24.72■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.72■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.72■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 MORC4Q8TE76 937 aa24.72■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 PNMA2Q9UL42 364 aa24.72■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 CTAGE5O15320 804 aa24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 SNHG28P0DPA3 235 aa24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 PDHBP11177 359 aa24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 RAG1P15918 1043 aa24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 CDK7P50613 346 aa24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 SNAP25P60880 206 aa24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 HAND2P61296 217 aa24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 MTMR7Q9Y216 660 aa24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 HIP1O00291 1037 aa24.7■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 TNFAIP2Q03169 654 aa24.7■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 GNASQ5JWF2 1037 aa24.7■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.7■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A2P36021 539 aa24.69■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF543Q08ER8 600 aa24.69■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.69■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 ESR2Q92731 530 aa24.69■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 TBX21Q9UL17 535 aa24.69■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 Q9Y3F1 56 aa24.69■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 NEDD4P46934 1319 aa24.68■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.68■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF213O14771 459 aa24.68■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.68■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 NSMFQ6X4W1 530 aa24.68■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 TLK2Q86UE8 772 aa24.68■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 VTA1Q9NP79 307 aa24.68■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 ARVCFO00192 962 aa24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 CABYRO75952 493 aa24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 FPGSQ05932 587 aa24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF697Q5TEC3 545 aa24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 DGKHQ86XP1 1220 aa24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 CDH23Q9H251 3354 aa24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 TIMP1P01033 207 aa24.66■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.66■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.66■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 GUCD1Q96NT3 240 aa24.66■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.66■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.66■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.66■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 NFIBO00712 420 aa24.65■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 SMPD1P17405 629 aa24.65■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 EPHB4P54760 987 aa24.65■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.65■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD5Q6N075 450 aa24.64■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 IQCA1Q86XH1 822 aa24.64■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.64■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 MAF1Q9H063 256 aa24.64■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.64■■□□□ 1.54
LIMS1-208ENST00000428064 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 ZEB2O60315 1214 aa24.63■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 CD4P01730 458 aa24.63■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 BEX3Q00994 111 aa24.63■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 ANKS1AQ92625 1134 aa24.63■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.63■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.63■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 UNC80Q8N2C7 3258 aa24.62■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM265A0A087WTH1 108 aa24.62■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.62■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
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