RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 GJA10Q969M2 543 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 I3L4J1 428 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D8O95759 1140 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL1O95922 423 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 IFNAR1P17181 557 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ODR4Q5SWX8 454 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SH3BP5O60239 455 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PDE6CP51160 858 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ATP2A3Q93084 1043 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 RAB20Q9NX57 234 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 M0R2C6 588 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB2P05120 415 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 HESX1Q9UBX0 185 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 IKBKBO14920 756 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 OSBP2Q969R2 916 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SULF1Q8IWU6 871 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CSRNP1Q96S65 589 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.23■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 NOL3O60936 208 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SYNMO15061 1565 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 TMOD1P28289 359 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF131P52739 623 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 BUB1O43683 1085 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 RNF40O75150 1001 aa22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM37O94972 964 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SLFN14P0C7P3 912 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SLC12A2P55011 1212 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 BPIFB4P59827 614 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 LIFRP42702 1097 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 GUCY2FP51841 1108 aa22.21■■□□□ 1.15
CCSAP-203ENST00000366687 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 604 ms