RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 C5orf60A6NFR6 353 aa24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 MOCS3O95396 460 aa24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 SPA17Q15506 151 aa24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 RTN1Q16799 776 aa24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 TMBIM4Q9HC24 238 aa24.15■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 WNT7AO00755 349 aa24.14■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 ARMC2Q8NEN0 867 aa24.14■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 SHISA4Q96DD7 197 aa24.14■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 SEC16BQ96JE7 1060 aa24.14■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 EPB41L5Q9HCM4 733 aa24.14■■□□□ 1.46
OPN3-201ENST00000366554 ESYT3A0FGR9 886 aa24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ACCSLQ4AC99 568 aa24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 RMND1Q9NWS8 449 aa24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ADD2P35612 726 aa24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ADSSL1Q8N142 457 aa24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ABCC12Q96J65 1359 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 BMP15O95972 392 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 RPN1P04843 607 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 HPDP32754 393 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 GUCY2FP51841 1108 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 IFT81Q8WYA0 676 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 P3H4Q92791 437 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 CCDC42Q96M95 316 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 THAP9Q9H5L6 903 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 BATF3Q9NR55 127 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 B4DLN1 442 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 KLK7P49862 253 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 GUCY2DQ02846 1103 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 WHAMMQ8TF30 809 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 TLR10Q9BXR5 811 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 EBF2Q9HAK2 575 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.13■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ATP6V1G2O95670 118 aa24.12■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 CCT6BQ92526 530 aa24.12■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 LRP6O75581 1613 aa24.12■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 DISP2A7MBM2 1401 aa24.12■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 NOD2Q9HC29 1040 aa24.12■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 EXOC1Q9NV70 894 aa24.12■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 PLAAQ9Y263 795 aa24.12■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.11■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD33BA6NCL7 494 aa24.11■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ATRNO75882 1429 aa24.11■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.11■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 NCK2O43639 380 aa24.11■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 GHRP10912 638 aa24.11■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ICA1Q05084 483 aa24.11■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa24.11■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 MYH10P35580 1976 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 CUL5Q93034 780 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 MS4A14Q96JA4 679 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 KDM4CQ9H3R0 1056 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 PLCB1Q9NQ66 1216 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.1■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 A0A1W2PQJ5 194 aa24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 LCA5LO95447 670 aa24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 GCKP35557 465 aa24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 FIGNQ5HY92 759 aa24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 LRIG3Q6UXM1 1119 aa24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 HVCN1Q96D96 273 aa24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 RNF14Q9UBS8 474 aa24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 TNRQ92752 1358 aa24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 PPIP5K2O43314 1243 aa24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 PAEPP09466 180 aa24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
OPN3-201ENST00000366554 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms