RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 A0A1B0GVL5 298 aa27.17■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 BMP15O95972 392 aa27.17■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.17■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 TBCKQ8TEA7 893 aa27.17■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 SYCE3A1L190 88 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 CMA1P23946 247 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 GRIN1Q05586 938 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 PTGDRQ13258 359 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 SHC4Q6S5L8 630 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 ENGASEQ8NFI3 743 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 USP17L15C9J2P7 530 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 USP17L13C9JLJ4 530 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 USP17L11C9JVI0 530 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 USP17L18D6R9N7 530 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 USP17L22D6RA61 530 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 USP17L17D6RBQ6 530 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 USP17L19D6RCP7 530 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 USP17L20D6RJB6 530 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 FLOT1O75955 427 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 ZNF445P59923 1031 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 USP17L24Q0WX57 530 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 USP17L6PQ6QN14 398 aa27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 OPLAHO14841 1288 aa27.15■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 FAM160A1Q05DH4 1040 aa27.15■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 MAP3K11Q16584 847 aa27.15■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa27.15■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 CLMNQ96JQ2 1002 aa27.15■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 ELP3Q9H9T3 547 aa27.15■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 MEIS2O14770 477 aa27.14■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 NDUFA8P51970 172 aa27.14■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 NEK8Q86SG6 692 aa27.14■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa27.14■■□□□ 1.94
TMIE-201ENST00000326431 TRAF1Q13077 416 aa27.13■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 LETM2Q2VYF4 491 aa27.13■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 RESP18Q5W5W9 173 aa27.13■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 C4orf32Q8N8J7 132 aa27.13■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 NUP62CLQ9H1M0 184 aa27.13■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.13■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 PFKFB1P16118 471 aa27.13■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 SH3D19Q5HYK7 790 aa27.13■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 TMOD4Q9NZQ9 345 aa27.13■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 ZNF536O15090 1300 aa27.13■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 TRAF5O00463 557 aa27.12■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 SPECC1Q5M775 1068 aa27.12■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 LDHDQ86WU2 507 aa27.12■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 CLSTN2Q9H4D0 955 aa27.12■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 EDIL3O43854 480 aa27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 CAMK4Q16566 473 aa27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 ARMC9Q7Z3E5 817 aa27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 ICAM1P05362 532 aa27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 GAS2L3Q86XJ1 694 aa27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 FERMT2Q96AC1 680 aa27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 AGBL1Q96MI9 1066 aa27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 CSRNP2Q9H175 543 aa27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 HPSEQ9Y251 543 aa27.11■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa27.1■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 ERO1BQ86YB8 467 aa27.1■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 TMEM60Q9H2L4 133 aa27.1■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 PPATQ06203 517 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 OTUD5Q96G74 571 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 TNMDQ9H2S6 317 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 CCPG1Q9ULG6 757 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 ABCB11O95342 1321 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 SPDYE5A6NIY4 337 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 AP3B2Q13367 1082 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 LRSAM1Q6UWE0 723 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 ATG4CQ96DT6 458 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 WNK4Q96J92 1243 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 ANO3Q9BYT9 981 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 ZNF408Q9H9D4 720 aa27.09■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 VWA3AA6NCI4 1184 aa27.08■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 IRF6O14896 467 aa27.08■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 KINO60870 393 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 IL17AQ16552 155 aa27.08■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa27.08■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 NMRK2Q9NPI5 230 aa27.08■■□□□ 1.93
TMIE-201ENST00000326431 PIK3CDO00329 1044 aa27.07■■□□□ 1.92
TMIE-201ENST00000326431 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
TMIE-201ENST00000326431 CPXCR1Q8N123 301 aa27.07■■□□□ 1.92
TMIE-201ENST00000326431 TBC1D5Q92609 795 aa27.07■■□□□ 1.92
TMIE-201ENST00000326431 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms