RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626583.2

LINC01828-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1828, human

TSL 5

Gene LINC01828, Length 848 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01828-208	ENST00000626583	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	USP16	Q9Y5T5	823 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	DNM1L	O00429	736 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	LILRA1	O75019	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	LILRB3	O75022	631 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CA3	P07451	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CSF2RA	P15509	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PPIL2	Q13356	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	GRAP	Q13588	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	RASA3	Q14644	834 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CCDC6	Q16204	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ERO1B	Q86YB8	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	COA7	Q96BR5	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	NLRP3	Q96P20	1036 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583		R4GN57	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	POLQ	O75417	2590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	KCNQ3	O43525	872 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	TAP1	Q03518	808 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	HINFP	Q9BQA5	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	TET1	Q8NFU7	2136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PEX10	O60683	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	C1QL1	O75973	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SLC5A1	P13866	664 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	DGKG	P49619	791 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SHC2	P98077	582 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	EYA3	Q99504	573 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PHF24	Q9UPV7	400 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01828-208	ENST00000626583	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	TIMP1	P01033	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	GATA4	P43694	442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	CCR10	P46092	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	DOC2B	Q14184	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC01828-208	ENST00000626583	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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