RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 PTPRFP10586 1907 aa17.09■□□□□ 0.33
NPIPB11-202ENST00000614927 PTPDC1A2A3K4 754 aa17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 JAK2O60674 1132 aa17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 BECN1Q14457 450 aa17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 TMEM132BQ14DG7 1078 aa17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 MB21D1Q8N884 522 aa17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 AGBL1Q96MI9 1066 aa17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 BEGAINQ9BUH8 593 aa17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 TXNRD2Q9NNW7 524 aa17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.08■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ZBTB5O15062 677 aa17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 CNMDO75829 334 aa17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 FDX1P10109 184 aa17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 USH1GQ495M9 461 aa17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 LBX2Q6XYB7 198 aa17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 FBXO11Q86XK2 927 aa17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 CCPG1Q9ULG6 757 aa17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.07■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 TLR2O60603 784 aa17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 STAT3P40763 770 aa17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 Q3C1V9 767 aa17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 REPS2Q8NFH8 660 aa17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 MTMR8Q96EF0 704 aa17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 HOMER2Q9NSB8 354 aa17.06■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ICAM1P05362 532 aa17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ALAS1P13196 640 aa17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 FOSBP53539 338 aa17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ERVK-9P63128 1117 aa17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ERVK-24P63145 666 aa17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 WDR78Q5VTH9 848 aa17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 COA7Q96BR5 231 aa17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 AMNQ9BXJ7 453 aa17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 SMC3Q9UQE7 1217 aa17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa17.05■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF536O15090 1300 aa17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 DEXIO95424 95 aa17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 CUL4AQ13619 759 aa17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 NCAPG2Q86XI2 1143 aa17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 FAM184AQ8NB25 1140 aa17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 AIFM3Q96NN9 605 aa17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 TEX13BQ9BXU2 312 aa17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 TSKSQ9UJT2 592 aa17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ADGRA2Q96PE1 1338 aa17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 SCG2P13521 617 aa17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 FDPSP14324 419 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 OAZ1P54368 228 aa17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 CCNA1P78396 465 aa17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 PKN1Q16512 942 aa17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 WWC2Q6AWC2 1192 aa17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 C17orf99Q6UX52 265 aa17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 TRERF1Q96PN7 1200 aa17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 MORF4L1Q9UBU8 362 aa17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 RIPK3Q9Y572 518 aa17.03■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ATP2A1O14983 1001 aa17.02■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 BCRP11274 1271 aa17.02■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 GJB2P29033 226 aa17.02■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 NAPAP54920 295 aa17.02■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 FAM110CQ1W6H9 321 aa17.02■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 RIOX2Q8IUF8 465 aa17.02■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa17.02■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 WASF1Q92558 559 aa17.02■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 ALG1Q9BT22 464 aa17.02■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 RNF146Q9NTX7 359 aa17.02■□□□□ 0.32
NPIPB11-202ENST00000614927 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 STK36Q9NRP7 1315 aa17.01■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 ERCC3P19447 782 aa17.01■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 TRAF1Q13077 416 aa17.01■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 MUM1L1Q5H9M0 696 aa17.01■□□□□ 0.31
NPIPB11-202ENST00000614927 PORCNQ9H237 461 aa17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms