RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 CEP290O15078 2479 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PLIN1O60240 522 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 NPR3P17342 541 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAP2K3P46734 347 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 TM4SF4P48230 202 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRT76Q01546 638 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLFN5Q08AF3 891 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 UBE4AQ14139 1066 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 CFAP100Q494V2 611 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 GUCD1Q96NT3 240 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 HCN2Q9UL51 889 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PIEZO1Q92508 2521 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTC28Q96AY4 2481 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 AOX1Q06278 1338 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 F8W031 263 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 H3BRB1 525 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 C2CD2LO14523 706 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 GYG1P46976 350 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAP3K11Q16584 847 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRRC24Q50LG9 513 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPR152Q8TDT2 470 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 JAG2Q9Y219 1238 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP20Q9Y2K6 914 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 KIF16BQ96L93 1317 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 CLRN2A0PK11 232 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 UNCXA6NJT0 531 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 MYO1BO43795 1136 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDE8BO95263 885 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PCSK2P16519 638 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPEM2Q0P670 501 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 SREBF2Q12772 1141 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCINQ13939 588 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRKG1Q13976 671 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 GRIN2CQ14957 1233 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 METTL24Q5JXM2 366 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 NBPF11Q86T75 865 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 ATCAYQ86WG3 371 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTC16Q8NEE8 873 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 PNMA5Q96PV4 448 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC30A3Q99726 388 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 GSX2Q9BZM3 304 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP44Q9H0E7 712 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 FZD1Q9UP38 647 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 AK9Q5TCS8 1911 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 DOCK2Q92608 1830 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 WIPF1O43516 503 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRT37O76014 449 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 FGFR2P21802 821 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 CRKP46108 304 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 RASA3Q14644 834 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC8-202ENST00000577426 EDEM1Q92611 657 aa6.29□□□□□ -1.4
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