RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CEP95Q96GE4 821 aa13.96□□□□□ -0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABHD10Q9NUJ1 306 aa13.96□□□□□ -0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa13.96□□□□□ -0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa13.96□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LAMB1P07942 1786 aa13.96□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C6orf229H3BNL8 230 aa13.96□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERVK-24P63145 666 aa13.96□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PICALMQ13492 652 aa13.96□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SOGA3Q5TF21 947 aa13.96□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa13.96□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADSSL1Q8N142 457 aa13.96□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ROBO3Q96MS0 1386 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LRRC10BA6NIK2 292 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 F8W031 263 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABL1P00519 1130 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLCG1P19174 1290 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TECP42680 631 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EIF6P56537 245 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STIM1Q13586 685 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TXNRD1Q16881 649 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CABP7Q86V35 215 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIGSQ96S52 555 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLF1Q9BQI6 1058 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FLT1P17948 1338 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H7C1D1 291 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GALNT17Q6IS24 598 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DAGLBQ8NCG7 672 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LRRC15Q8TF66 581 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C6orf50Q9HD87 102 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FHOD1Q9Y613 1164 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ITIH6Q6UXX5 1313 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP17L5A8MUK1 530 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PSMA7O14818 248 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR52Z1P0C646 297 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C16orf86Q6ZW13 317 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IRF2BP1Q8IU81 584 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMTC1Q8IUR5 882 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC51Q96ER9 411 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LZTS2Q9BRK4 669 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NEDD1Q8NHV4 660 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZMYND12Q9H0C1 365 aa13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLRC4O43908 158 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GNA11P29992 359 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ASIC1P78348 528 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ST5P78524 1137 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KRT25Q7Z3Z0 450 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC35F6Q8N357 371 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TBCKQ8TEA7 893 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHP1Q99653 195 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPZ1Q9BXG8 430 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCSER1Q9C0I3 900 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KBTBD4Q9NVX7 518 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM260Q9NX78 707 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RIMBP2O15034 1052 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TFRCP02786 760 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SERPINB2P05120 415 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP2B4P23634 1241 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDE4DQ08499 809 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NEK8Q86SG6 692 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLEC10AQ8IUN9 316 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GOLGA1Q92805 767 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 POLLQ9UGP5 575 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EP400Q96L91 3159 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BTAF1O14981 1849 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTC26A0AVF1 554 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLCG2P16885 1265 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TXKP42681 527 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GTF2IP78347 998 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EXOC1Q9NV70 894 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CTAGE9A4FU28 777 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 B4DLN1 442 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LAD1O00515 517 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RHBDL3P58872 404 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHMP4BP1P59074 171 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRIM14Q14142 442 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KCNB1Q14721 858 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms