RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 ARID5AQ03989 594 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 NLRX1Q86UT6 975 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 KSR1Q8IVT5 923 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 NAT16Q8N8M0 369 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 ETFBP38117 255 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 KIR3DS1Q14943 382 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF124Q15973 351 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 FAM84AQ96KN4 292 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 A0A087WZG4 1122 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 PPM1BO75688 479 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 POU4F1Q01851 419 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 SNX17Q15036 470 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 SLC38A3Q99624 504 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 B2RBV5 119 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 VAMP4O75379 141 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 PDE6BP35913 854 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 TNNI3KQ59H18 835 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 JMJD8Q96S16 334 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 STXBP3O00186 592 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 PKN1Q16512 942 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 ADGRF1Q5T601 910 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF605Q86T29 641 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 PRKCAP17252 672 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 SDHBP21912 280 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 NCAPHQ15003 741 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 NUP43Q8NFH3 380 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PQY0 241 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 AURKAO14965 403 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 APBA2Q99767 749 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 LGR4Q9BXB1 951 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 AKT3Q9Y243 479 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 OR14I1A6ND48 311 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 DDAH1O94760 285 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 PNLIPP16233 465 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 AMPD2Q01433 879 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 GRB10Q13322 594 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 LCE3BQ5TA77 95 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 JAMLQ86YT9 394 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 GMLQ99445 158 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 KCNH1O95259 989 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 NAT2P11245 290 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 BVESQ8NE79 360 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PQ27 194 aa7.43□□□□□ -1.22
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