RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 NBPF11Q86T75 865 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 GSTM1P09488 218 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 RTP2Q5QGT7 225 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ZPBP2Q6X784 338 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 SPATC1Q76KD6 591 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC120Q96HB5 630 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRK-215ENST00000498284 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
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PTPRK-215ENST00000498284 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1W2PQU0 124 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 TBX1O43435 398 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 IFNGR1P15260 489 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 LCE3BQ5TA77 95 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 STXBP3O00186 592 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 AURKAO14965 403 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 HK2P52789 917 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 PPP2R2AP63151 447 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 DUSP4Q13115 394 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 DNAJC7Q99615 494 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 PIF1Q9H611 641 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 GDNFP39905 211 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 EBF1Q9UH73 591 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 CAPNS1P04632 268 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 HOXC12P31275 282 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 SEPHS1P49903 392 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 CBLL1Q75N03 491 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 NAT16Q8N8M0 369 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 MAP6Q96JE9 813 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 GRIA2P42262 883 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 SCRN1Q12765 414 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRK-215ENST00000498284 CCDC140Q96MF4 163 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 ADCY3O60266 1144 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 KCNJ6P48051 423 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 ERVFC1P60507 584 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 CHRNEQ04844 493 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 CYP4F3Q08477 520 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 KSR1Q8IVT5 923 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 LILRB2Q8N423 598 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 OXR1Q8N573 874 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-215ENST00000498284 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.68□□□□□ -1.34
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