RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 GRB10Q13322 594 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 MCTP1Q6DN14 999 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.91□□□□□ -1.62
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF205O95201 554 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNGR1P15260 489 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 VAV1P15498 845 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIA2P42262 883 aa4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 POU4F1Q01851 419 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 TEKQ02763 1124 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 ZP2Q05996 745 aa4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZPBP2Q6X784 338 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF111Q6ZNA4 994 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 JAZF1Q86VZ6 243 aa4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 SGSM3Q96HU1 749 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC12A9Q9BXP2 914 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 PRDM7Q9NQW5 492 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM82A0PJX8 343 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 ADCY3O60266 1144 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 GSTM1P09488 218 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM153BP0C7A2 387 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 SF1Q15637 639 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 RTP2Q5QGT7 225 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 AP5S1Q9NUS5 200 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 WNT11O96014 354 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 CYP4F3Q08477 520 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 WAPLQ7Z5K2 1190 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 TP53INP2Q8IXH6 220 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 CDADC1Q9BWV3 514 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 LMCD1Q9NZU5 365 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 SLAMF8Q9P0V8 285 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 PRODHO43272 600 aa4.87□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 ECI1P42126 302 aa4.87□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 KCNJ6P48051 423 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 GFRA1P56159 465 aa4.87□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 PLCL1Q15111 1095 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 JMYQ8N9B5 988 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 ALPK1Q96QP1 1244 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 IER2Q9BTL4 223 aa4.87□□□□□ -1.63
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 TBX22Q9Y458 520 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 ESYT3A0FGR9 886 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 TLDC2A0PJX2 215 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 C2orf71A6NGG8 1288 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 THBDP07204 575 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 FGFR1P11362 822 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-211ENST00000489450 HOXC12P31275 282 aa4.86□□□□□ -1.63
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