RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM84AQ96KN4 292 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 TINF2Q9BSI4 451 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 NRDCO43847 1150 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 CD3EP07766 207 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 RTP1P59025 263 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-206ENST00000467748 VAMP4O75379 141 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT1P04264 644 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 PDE6BP35913 854 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ETFBP38117 255 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 TCEAL1Q15170 157 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 VHLLQ6RSH7 139 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF605Q86T29 641 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 LGR4Q9BXB1 951 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ADGRF1Q5T601 910 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 JMJD8Q96S16 334 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC38A3Q99624 504 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 WHRNQ9P202 907 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 B2RBV5 119 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 C1QTNF9P0C862 333 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 SNX17Q15036 470 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 VPS37DQ86XT2 251 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A087WZG4 1122 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 DBX1A6NMT0 343 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 STXBP3O00186 592 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 FGRP09769 529 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGGTB-206ENST00000467748 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 NAT16Q8N8M0 369 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 SGPP1Q9BX95 441 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 GBP3Q9H0R5 595 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 E9PSI1 815 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 PPM1BO75688 479 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 MSL3P1P0C860 447 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 POU4F1Q01851 419 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 PKN1Q16512 942 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 NUP43Q8NFH3 380 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ARID5AQ03989 594 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNN1Q92952 543 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1W2PQY0 241 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 OR14I1A6ND48 311 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 TSPAN15O95858 294 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 PNLIPP16233 465 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 RAP1GAPP47736 663 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-206ENST00000467748 MVKQ03426 396 aa6.65□□□□□ -1.34
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