RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 MGEA5O60502 916 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT19P08727 400 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 H2AFZP0C0S5 128 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP1A2P50993 1020 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 H2AFVQ71UI9 128 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PALM2Q8IXS6 379 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MYOCDQ8IZQ8 938 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PICK1Q9NRD5 415 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF532Q9HCE3 1301 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNJ18B7U540 433 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 GNPATO15228 680 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ZAP70P43403 619 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CTDSPL2Q05D32 466 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 GCKRQ14397 625 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNJ12Q14500 433 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF654Q8IZM8 581 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 SUCLG2Q96I99 432 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 AZI2Q9H6S1 392 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ST7Q9NRC1 585 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPC6Q9Y210 931 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP5JP18859 108 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIML1Q8N9V2 468 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 GSDMBQ8TAX9 411 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 NOSTRINQ8IVI9 506 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPS2Q9BXY5 557 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 GGA1Q9UJY5 639 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 H7C1D1 291 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 GCKP35557 465 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP4R1Q8TF05 950 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT12Q99456 494 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8KD6RF30 607 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 NR1I2O75469 434 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 GABPAQ06546 454 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAPPC3LQ5T215 181 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 RSAD2Q8WXG1 361 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 UIMC1Q96RL1 719 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 NACA2Q9H009 215 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 C19orf44Q9H6X5 657 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR46O15213 610 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF5LO75529 589 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 CMA1P23946 247 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 LIG3P49916 1009 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 STAG1Q8WVM7 1258 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 OVOS2Q6IE36 1432 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 PHBP35232 272 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 ADCY8P40145 1251 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 CUL4BQ13620 913 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 C8orf37Q96NL8 207 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 HAUS2Q9NVX0 235 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 SMCO2A6NFE2 343 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 TOM1O60784 492 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 A1BGP04217 495 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA5Q8NB90 893 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP61Q8NHU2 1237 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 DPH5Q9H2P9 285 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 FANCLQ9NW38 375 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 MORC3Q14149 939 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 USH1GQ495M9 461 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 TPH2Q8IWU9 490 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 TEKT1Q969V4 418 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 MTMR6Q9Y217 621 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 GAS7O60861 476 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNA6P17658 529 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC8A1P32418 973 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 APBA1Q02410 837 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 DBN1Q16643 649 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF827Q17R98 1081 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 FAN1Q9Y2M0 1017 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 USP19O94966 1318 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 CLTAP09496 248 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 SETSIPP0DME0 302 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2J2P51589 502 aa12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 GRK7Q8WTQ7 553 aa12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms