RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, human

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1A-204	ENST00000424089	GRM4	Q14833	912 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	GRIK5	Q16478	980 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	CCL15	Q16663	113 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		11.48	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	FLT1	P17948	1338 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089		A0A1B0GVL5	298 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	TRIM75P	A6NK02	468 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	SMIM22	K7EJ46	135 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	GNRH1	P01148	92 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	SCG2	P13521	617 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	PFKFB1	P16118	471 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	RASA1	P20936	1047 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	PTPRE	P23469	700 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	SYK	P43405	635 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	NOV	P48745	357 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	CDK8	P49336	464 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	PRMT2	P55345	433 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	KANK3	Q6NY19	840 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		11.46	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		11.46	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	SARM1	Q6SZW1	724 aa		11.46	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.46	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	FERMT2	Q96AC1	680 aa		11.46	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		11.46	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.46	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
POLR1A-204	ENST00000424089	CEP290	O15078	2479 aa		11.46	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	BECN2	A8MW95	431 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	NMT2	O60551	498 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	CETP	P11597	493 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	CDC25B	P30305	580 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	PLCD1	P51178	756 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	NLRP12	P59046	1061 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	TPM4	P67936	248 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	MAP3K9	P80192	1104 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	IQCB1	Q15051	598 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	SHC4	Q6S5L8	630 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	TNFRSF25	Q93038	417 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	CABP5	Q9NP86	173 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		11.45	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	BRCA2	P51587	3418 aa		11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	SMTNL1	A8MU46	457 aa		11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	TLR2	O60603	784 aa		11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	HOXD10	P28358	340 aa		11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	NLRP5	P59047	1200 aa		11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	CAP1	Q01518	475 aa		11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	NR5A1	Q13285	461 aa		11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	VGLL4	Q14135	290 aa		11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	LUZP1	Q86V48	1076 aa		11.44	□□□□□ -0.58
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.9 ms