RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L5A8MUK1 530 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CALML3P27482 149 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PDE4DQ08499 809 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PNOCQ13519 176 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 IQCB1Q15051 598 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC38Q5R3I4 469 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DRC7Q8IY82 874 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CEP57L1Q8IYX8 460 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 BLIDQ8IZY5 108 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TTLL6Q8N841 843 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ZDHHC15Q96MV8 337 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TIGD1Q96MW7 591 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CSRNP2Q9H175 543 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 MTMR4Q9NYA4 1195 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SNED1Q8TER0 1413 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXN1O15353 648 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 RAD21O60216 631 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 MCM7P33993 719 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 LTBP1Q14766 1721 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DPCR1Q3MIW9 517 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 WWC2Q6AWC2 1192 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 AOPEPQ8N6M6 819 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFRSF25Q93038 417 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 LZTS2Q9BRK4 669 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SERTAD1Q9UHV2 236 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHA4Q9UN74 947 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMB1P07942 1786 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SLX4Q8IY92 1834 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 YDJCA8MPS7 323 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DPEP1P16444 411 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SHMT1P34896 483 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SUPT20HQ8NEM7 779 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC148Q8NFR7 591 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 EPSTI1Q96J88 318 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PIGSQ96S52 555 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3GLB2Q9NR46 395 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SWAP70Q9UH65 585 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 RAD17O75943 681 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TTLL1O95922 423 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PDHBP11177 359 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NAPAP54920 295 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NLRP12P59046 1061 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP100Q494V2 611 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 LARGE2Q8N3Y3 721 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DHX58Q96C10 678 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 MRIQ9BWK5 157 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SPZ1Q9BXG8 430 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM34Q9BYJ4 488 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 BARHL2Q9NY43 387 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM198AQ9UFP1 575 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NAV1Q8NEY1 1877 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ECM29Q5VYK3 1845 aa4.54□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SMCO2A6NFE2 343 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 STXBP3O00186 592 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB7AO95365 584 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 BMP15O95972 392 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC93Q567U6 631 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SOGA3Q5TF21 947 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PI4KBQ9UBF8 816 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SERPINA10Q9UK55 444 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 MYH6P13533 1939 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 MYH1P12882 1939 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 AFMP43652 599 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAPPC10P48553 1259 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NOVP48745 357 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF75DP51815 510 aa4.53□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 INF2Q27J81 1249 aa4.53□□□□□ -1.68
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