RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 ZSCAN26Q16670 478 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 TNKSO95271 1327 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 BTDP43251 543 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 PPP2R5EQ16537 467 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 SESTD1Q86VW0 696 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 BUB1O43683 1085 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 SCG2P13521 617 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 ABCB4P21439 1286 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.52■■□□□ 1.36
ANKRD28-201ENST00000399451 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 VCXQ9H320 206 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 ST7Q9NRC1 585 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 LIG4P49917 911 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 SCRN1Q12765 414 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 CLIC6Q96NY7 704 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 IGBP1P78318 339 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF827Q17R98 1081 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 NEK8Q86SG6 692 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 DPP9Q86TI2 863 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 ETF1P62495 437 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PRR16Q569H4 304 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 EPSTI1Q96J88 318 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 MMS19Q96T76 1030 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 RAB20Q9NX57 234 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 KCNQ3O43525 872 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 RASSF2P50749 326 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 XKR9Q5GH70 373 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 MIPOL1Q8TD10 442 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 TNNC2P02585 160 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 FGAP02671 866 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.354e-41■■■■■ 172.6
ANKRD28-201ENST00000399451 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 IL17REQ8NFR9 667 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 ICA1Q05084 483 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PHKG2P15735 406 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.359e-8■■■■□ 24
ANKRD28-201ENST00000399451 TSC1Q92574 1164 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 BCAMP50895 628 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 FBXO11Q86XK2 927 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 ATP2A3Q93084 1043 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 CAPN9O14815 690 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 OSBPP22059 807 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PALM2Q8IXS6 379 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PNMA1Q8ND90 353 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.49■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PHBP35232 272 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT12Q99456 494 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 NUF2Q9BZD4 464 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 A0A1W2PQ27 194 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 A0A1W2PQ64 194 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 A0A1W2PQD8 194 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 STAP2Q9UGK3 403 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 BTBD18B2RXH4 712 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC13Q8IYE1 715 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.353e-9■■□□□ 13
ANKRD28-201ENST00000399451 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 TMOD1P28289 359 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 RILPQ96NA2 401 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD28-201ENST00000399451 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms