RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383698.3

VGLL3-201, Transcript of vestigial like family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGLL3, Length 2,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3-201ENST00000383698 UFL1O94874 794 aa24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 PPP4CP60510 307 aa24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 LETM2Q2VYF4 491 aa24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 KRT9P35527 623 aa24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CDK8P49336 464 aa24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 TEX11Q8IYF3 940 aa24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CCDC51Q96ER9 411 aa24.19■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.18■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 KLRC4O43908 158 aa24.18■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.18■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 TERF2Q15554 542 aa24.18■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.18■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 SNED1Q8TER0 1413 aa24.18■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 LDHCP07864 332 aa24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 PLA2G4AP47712 749 aa24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 SLC35F6Q8N357 371 aa24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 GOLGA1Q92805 767 aa24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 TRIM47Q96LD4 638 aa24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 PLCG1P19174 1290 aa24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CHP1Q99653 195 aa24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 PARD6BQ9BYG5 372 aa24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CD209Q9NNX6 404 aa24.17■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 SMCO2A6NFE2 343 aa24.16■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 H7C1D1 291 aa24.16■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 FECHP22830 423 aa24.16■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 TXNRD1Q16881 649 aa24.16■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CYP26C1Q6V0L0 522 aa24.16■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.16■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 GALNT17Q6IS24 598 aa24.16■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CABP7Q86V35 215 aa24.16■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.16■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 FLT1P17948 1338 aa24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CEP95Q96GE4 821 aa24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 TTC26A0AVF1 554 aa24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CHMP4BP1P59074 171 aa24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 PIGSQ96S52 555 aa24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.15■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
VGLL3-201ENST00000383698 SASH3O75995 380 aa24.14■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 OR52Z1P0C646 297 aa24.14■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 MB21D1Q8N884 522 aa24.14■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 PSMA7O14818 248 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 TECP42680 631 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 TRIM14Q14142 442 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 KCNB1Q14721 858 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 RABGGTAQ92696 567 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 CTAGE9A4FU28 777 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 RHOBTB3O94955 611 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 ARHGAP25P42331 645 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 STIM1Q13586 685 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 TMEM260Q9NX78 707 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 USP17L5A8MUK1 530 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 LGALS16A8MUM7 142 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 B4DLN1 442 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 CDC23Q9UJX2 597 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 LAD1O00515 517 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 TBC1D8O95759 1140 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 PRPHP41219 470 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 HPS3Q969F9 1004 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 C6orf50Q9HD87 102 aa24.12■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 SOGA3Q5TF21 947 aa24.11■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 TTI2Q6NXR4 508 aa24.11■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 TBCKQ8TEA7 893 aa24.11■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 GGA1Q9UJY5 639 aa24.11■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 TFR2Q9UP52 801 aa24.11■■□□□ 1.45
VGLL3-201ENST00000383698 KIF20AO95235 890 aa24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms