RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ASNSP08243 561 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 GNA11P29992 359 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 IKQ13123 557 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PTGDRQ13258 359 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 RESP18Q5W5W9 173 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 RNF214Q8ND24 703 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CEP131Q9UPN4 1083 aa17.56■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF202O95125 648 aa17.55■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 DGKZQ13574 1117 aa17.55■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 USP49Q70CQ1 688 aa17.55■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 KINO60870 393 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SYDE2Q5VT97 1194 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CSRNP2Q9H175 543 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 GOPCQ9HD26 462 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 HPSEQ9Y251 543 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 TRAPPC10P48553 1259 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 IL17AQ16552 155 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2SQ16763 222 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 BTNL9Q6UXG8 535 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 C4orf32Q8N8J7 132 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF341Q9BYN7 854 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 VCPKMTQ9H867 229 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PRR12Q9ULL5 1215 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa17.54■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ESYT2A0FGR8 921 aa17.53■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 hCG_1984214I3L0E3 225 aa17.53■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ADCY7P51828 1080 aa17.53■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 GPR162Q16538 588 aa17.53■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 RIC8AQ9NPQ8 531 aa17.53■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 A0A087WWV3 80 aa17.52■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SYKP43405 635 aa17.52■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PRKG1Q13976 671 aa17.52■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa17.52■□□□□ 0.4
CASQ1-201ENST00000368078 EDIL3O43854 480 aa17.52■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 USH1GQ495M9 461 aa17.52■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TBCKQ8TEA7 893 aa17.52■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 SDF4Q9BRK5 362 aa17.52■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM60Q9H2L4 133 aa17.52■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.52■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 KCNH3Q9ULD8 1083 aa17.52■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 VWA3AA6NCI4 1184 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L15C9J2P7 530 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L13C9JLJ4 530 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L11C9JVI0 530 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L18D6R9N7 530 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L22D6RA61 530 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L17D6RBQ6 530 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L19D6RCP7 530 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L20D6RJB6 530 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 STAT2P52630 851 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L24Q0WX57 530 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 LONRF3Q496Y0 759 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 USP17L6PQ6QN14 398 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 KRT25Q7Z3Z0 450 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 KIFC2Q96AC6 838 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 EPSTI1Q96J88 318 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 PSTPIP2Q9H939 334 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF112Q9UJU3 913 aa17.51■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 TYRO3Q06418 890 aa17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 LETM2Q2VYF4 491 aa17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 DCAF15Q66K64 600 aa17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 WRNIP1Q96S55 665 aa17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC192P0DO97 292 aa17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO11Q86XK2 927 aa17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 CUL5Q93034 780 aa17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 FEZ1Q99689 392 aa17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 AMNQ9BXJ7 453 aa17.5■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 MYH7BA7E2Y1 1941 aa17.49■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 ADM5C9JUS6 153 aa17.49■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 BMP15O95972 392 aa17.49■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R18Q6NYC8 613 aa17.49■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 PDILTQ8N807 584 aa17.49■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 FERMT2Q96AC1 680 aa17.49■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 SH2D4AQ9H788 454 aa17.49■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
CASQ1-201ENST00000368078 SSC5DA1L4H1 1573 aa17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms