RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 BARHL2Q9NY43 387 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 OTOFQ9HC10 1997 aa6.93□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SLC16A2P36021 539 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 NLRP5P59047 1200 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 HOMER1Q86YM7 354 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ELP1O95163 1332 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ADM5C9JUS6 153 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 BMP3P12645 472 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 INPP5BP32019 993 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 NPY5RQ15761 445 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SULF1Q8IWU6 871 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GPT2Q8TD30 523 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 USP28Q96RU2 1077 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 FZD1Q9UP38 647 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 NR5A1Q13285 461 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 MTMR8Q96EF0 704 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 WRNIP1Q96S55 665 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 VCPKMTQ9H867 229 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CLIC4Q9Y696 253 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 POTECB2RU33 542 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 USP17L10C9JJH3 530 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 MARCH6O60337 910 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CALML3P27482 149 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KLRG1Q96E93 195 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.92□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 TMEM232C9JQI7 657 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 UBE2HP62256 183 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 DLK2Q6UY11 383 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 TNFRSF25Q93038 417 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB5O15062 677 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTS3O15072 1205 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CLCN1P35523 988 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 NAPAP54920 295 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GALNT17Q6IS24 598 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 BLIDQ8IZY5 108 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 MBD3O95983 291 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ANO1Q5XXA6 986 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 FEZ1Q99689 392 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PICK1Q9NRD5 415 aa6.91□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 M0R2N6 131 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PTPRAP18433 802 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PRKG1Q13976 671 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 COA7Q96BR5 231 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.9□□□□□ -1.3
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