RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317623.8

PCNX4-201, Transcript of pecanex 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene PCNX4, Length 17,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-201ENST00000317623 TNNI2P48788 182 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 GSTA1P08263 222 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 GSTA2P09210 222 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TRIM15Q9C019 465 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 SPARCL1Q14515 664 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PPP2R5DQ14738 602 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 STK24Q9Y6E0 443 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 WDR91A4D1P6 747 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 MMEP08473 750 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PLTPP55058 493 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 HAUS7Q99871 368 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM51Q9NW97 253 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 CDR2Q01850 454 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 GID8Q9NWU2 228 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 CYP7A1P22680 504 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 FMO2Q99518 471 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 RXRAP19793 462 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PPP2R2AP63151 447 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 FLOT2Q14254 428 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 IKBKBO14920 756 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 DNAJC6O75061 913 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 CUL4BQ13620 913 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PLCB4Q15147 1175 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 FAM83GA6ND36 823 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 SMTNP53814 917 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 ADCY2Q08462 1091 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 HIC2Q96JB3 615 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PLS3P13797 630 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM87BQ96K49 555 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PDE6BP35913 854 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 AK9Q5TCS8 1911 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 SLC12A2P55011 1212 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 RAB20Q9NX57 234 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 NSD2O96028 1365 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TRPC1P48995 793 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 KRT40Q6A162 431 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 SUPT3HO75486 399 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 RALGAPBQ86X10 1494 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 INHBAP08476 426 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 VSTM4Q8IW00 320 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 SERPINB10P48595 397 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 LDHCP07864 332 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 KRT82Q9NSB4 513 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 E9PMD0 336 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 STX8Q9UNK0 236 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 ESYT2A0FGR8 921 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TTI1O43156 1089 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.18□□□□□ -1.26
PCNX4-201ENST00000317623 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms