RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 TUBB2AQ13885 445 aa23.54■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 PPP1R7Q15435 360 aa23.54■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.54■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.54■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.367e-6■□□□□ 10.5
LRP5-201ENST00000294304 BMP3P12645 472 aa23.54■■□□□ 1.36
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LRP5-201ENST00000294304 XKR9Q5GH70 373 aa23.54■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.54■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 LIN9Q5TKA1 542 aa23.53■■□□□ 1.36
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LRP5-201ENST00000294304 CYP4A11Q02928 519 aa23.53■■□□□ 1.36
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LRP5-201ENST00000294304 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.53■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 CYP2J2P51589 502 aa23.53■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.53■■□□□ 1.36
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LRP5-201ENST00000294304 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.53■■□□□ 1.36
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LRP5-201ENST00000294304 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.53■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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LRP5-201ENST00000294304 TBCKQ8TEA7 893 aa23.52■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 GSDMAQ96QA5 445 aa23.52■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.52■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.52■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 CD209Q9NNX6 404 aa23.52■■□□□ 1.36
LRP5-201ENST00000294304 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 AIFM3Q96NN9 605 aa23.51■■□□□ 1.35
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LRP5-201ENST00000294304 TERF1P54274 439 aa23.51■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.51■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 COA7Q96BR5 231 aa23.51■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 AK8Q96MA6 479 aa23.51■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.51■■□□□ 1.35
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LRP5-201ENST00000294304 C21orf2O43822 256 aa23.5■■□□□ 1.35
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LRP5-201ENST00000294304 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.5■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 TTC14Q96N46 770 aa23.5■■□□□ 1.35
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LRP5-201ENST00000294304 JCADQ9P266 1359 aa23.5■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 DIP2AQ14689 1571 aa23.5■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.5■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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LRP5-201ENST00000294304 PGBD1Q96JS3 809 aa23.49■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 CARD6Q9BX69 1037 aa23.49■■□□□ 1.35
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LRP5-201ENST00000294304 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.49■■□□□ 1.35
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LRP5-201ENST00000294304 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.48■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 STAT2P52630 851 aa23.48■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 CYP2D6P10635 497 aa23.48■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 UBXN2AP68543 259 aa23.48■■□□□ 1.35
LRP5-201ENST00000294304 TRPC6Q9Y210 931 aa23.48■■□□□ 1.35
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