RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 RASGRP2Q7LDG7 609 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 LGALS16A8MUM7 142 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 TNNI2P48788 182 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ZBED6P86452 979 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 PSMD2Q13200 908 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 EXOC4Q96A65 974 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 UFL1O94874 794 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 NDUFA10O95299 355 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-201ENST00000264345 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-201ENST00000264345 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 KCPQ6ZWJ8 1503 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ALS2Q96Q42 1657 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ZNF18P17022 549 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 TXKP42681 527 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-201ENST00000264345 CUL4BQ13620 913 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 SEC23AQ15436 765 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.85□□□□□ -0.83
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HERC3-201ENST00000264345 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 TNIP1Q15025 636 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 NBPF3Q9H094 633 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 RUBCNQ92622 972 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ANO9A1A5B4 782 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 TOM1O60784 492 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 MAGEA1P43355 309 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 TMC4Q7Z404 712 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 SPAG5Q96R06 1193 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 NARFQ9UHQ1 456 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 TRAF5O00463 557 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 CALUO43852 315 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 CCDC93Q567U6 631 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 IFT20Q8IY31 132 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ACRBPQ8NEB7 543 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 TMOD2Q9NZR1 351 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 SWAP70Q9UH65 585 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 TEX33O43247 280 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RPS6KA4O75676 772 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 BTDP43251 543 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 RNF14Q9UBS8 474 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CLSTN1O94985 981 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CETN1Q12798 172 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 MAN2A1Q16706 1144 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 H0YHG0 523 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 BARHL2Q9NY43 387 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 B4DLN1 442 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CETN3O15182 167 aa9.83□□□□□ -0.84
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