RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CLDN11-201ENST00000064724 FAM182BQ5T319 152 aa19.52■□□□□ 0.72
CLDN11-201ENST00000064724 IRF2BP1Q8IU81 584 aa19.52■□□□□ 0.72
CLDN11-201ENST00000064724 TMTC1Q8IUR5 882 aa19.52■□□□□ 0.72
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CLDN11-201ENST00000064724 AK8Q96MA6 479 aa19.52■□□□□ 0.72
CLDN11-201ENST00000064724 VPS16Q9H269 839 aa19.52■□□□□ 0.72
CLDN11-201ENST00000064724 LY75O60449 1722 aa19.52■□□□□ 0.72
CLDN11-201ENST00000064724 PP2D1A8MPX8 630 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 RHOBTB3O94955 611 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 KRT25Q7Z3Z0 450 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 MAGEF1Q9HAY2 307 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 TAB2Q9NYJ8 693 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 UFL1O94874 794 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 GOLGA8HP0CJ92 632 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 RHBDL3P58872 404 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 PPP2R3AQ06190 1150 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 TEX11Q8IYF3 940 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 ABHD10Q9NUJ1 306 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 USP21Q9UK80 565 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 FHOD1Q9Y613 1164 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 NAV1Q8NEY1 1877 aa19.51■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 GGA1Q9UJY5 639 aa19.5■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 FLT1P17948 1338 aa19.5■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 GNA11P29992 359 aa19.5■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 THAP9Q9H5L6 903 aa19.5■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 LZTFL1Q9NQ48 299 aa19.5■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa19.5■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 GAKO14976 1311 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 KIF5CO60282 957 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 NAPAP54920 295 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 CYP26C1Q6V0L0 522 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 SLF2Q8IX21 1173 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 RASSF8Q8NHQ8 419 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 LRRC15Q8TF66 581 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 C6orf50Q9HD87 102 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 PODXL2Q9NZ53 605 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 MTMR7Q9Y216 660 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 OR52Z1P0C646 297 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 ERVK-24P63145 666 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 TUBB2AQ13885 445 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 TUBB2BQ9BVA1 445 aa19.49■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 A0A1W2PQC6 194 aa19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 SMCO2A6NFE2 343 aa19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 LGALS16A8MUM7 142 aa19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 BBOX1O75936 387 aa19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 PMS1P54277 932 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 UBXN1Q04323 297 aa19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 STIM1Q13586 685 aa19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 RABGGTAQ92696 567 aa19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 A0A0U1RQJ8 604 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 ESYT2A0FGR8 921 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 TRIM49BA6NDI0 452 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 PSMA7O14818 248 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 USP17L2Q6R6M4 530 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 TMCO3Q6UWJ1 677 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 CABP7Q86V35 215 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF507Q8TCN5 953 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 ATRIPQ8WXE1 791 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 CEP95Q96GE4 821 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 CPVLQ9H3G5 476 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 LRRC4BQ9NT99 713 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 ATP8B1O43520 1251 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 KRT9P35527 623 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 MFSD14BQ5SR56 506 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 TTI2Q6NXR4 508 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 NEK8Q86SG6 692 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 MB21D1Q8N884 522 aa19.47■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 PLCG1P19174 1290 aa19.46■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 TXNRD1Q16881 649 aa19.46■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 C7orf25Q9BPX7 421 aa19.46■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 RIOX1Q9H6W3 641 aa19.46■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 GYS1P13807 737 aa19.46■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 ST5P78524 1137 aa19.46■□□□□ 0.71
CLDN11-201ENST00000064724 LETM2Q2VYF4 491 aa19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms